Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY12

SCAPER, S phase cyclin A-associated protein in the endoplasmic reticulum, humanhuman

Predictions only

Length 1,400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAPERQ9BY12 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SCAPERQ9BY12 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SCAPERQ9BY12 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SCAPERQ9BY12 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SCAPERQ9BY12 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SCAPERQ9BY12 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SCAPERQ9BY12 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SCAPERQ9BY12 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SCAPERQ9BY12 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SCAPERQ9BY12 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SCAPERQ9BY12 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SCAPERQ9BY12 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SCAPERQ9BY12 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SCAPERQ9BY12 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SCAPERQ9BY12 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
SCAPERQ9BY12 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
SCAPERQ9BY12 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
SCAPERQ9BY12 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SCAPERQ9BY12 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SCAPERQ9BY12 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SCAPERQ9BY12 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
SCAPERQ9BY12 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SCAPERQ9BY12 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SCAPERQ9BY12 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SCAPERQ9BY12 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SCAPERQ9BY12 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SCAPERQ9BY12 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SCAPERQ9BY12 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SCAPERQ9BY12 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SCAPERQ9BY12 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
SCAPERQ9BY12 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SCAPERQ9BY12 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SCAPERQ9BY12 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SCAPERQ9BY12 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SCAPERQ9BY12 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SCAPERQ9BY12 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SCAPERQ9BY12 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SCAPERQ9BY12 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SCAPERQ9BY12 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SCAPERQ9BY12 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SCAPERQ9BY12 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
SCAPERQ9BY12 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SCAPERQ9BY12 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SCAPERQ9BY12 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SCAPERQ9BY12 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
SCAPERQ9BY12 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SCAPERQ9BY12 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SCAPERQ9BY12 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SCAPERQ9BY12 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SCAPERQ9BY12 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SCAPERQ9BY12 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SCAPERQ9BY12 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SCAPERQ9BY12 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
SCAPERQ9BY12 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SCAPERQ9BY12 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SCAPERQ9BY12 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SCAPERQ9BY12 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SCAPERQ9BY12 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SCAPERQ9BY12 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SCAPERQ9BY12 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SCAPERQ9BY12 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SCAPERQ9BY12 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SCAPERQ9BY12 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SCAPERQ9BY12 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SCAPERQ9BY12 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SCAPERQ9BY12 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SCAPERQ9BY12 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SCAPERQ9BY12 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SCAPERQ9BY12 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
SCAPERQ9BY12 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SCAPERQ9BY12 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
SCAPERQ9BY12 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SCAPERQ9BY12 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SCAPERQ9BY12 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SCAPERQ9BY12 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SCAPERQ9BY12 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SCAPERQ9BY12 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SCAPERQ9BY12 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SCAPERQ9BY12 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SCAPERQ9BY12 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SCAPERQ9BY12 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SCAPERQ9BY12 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SCAPERQ9BY12 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SCAPERQ9BY12 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SCAPERQ9BY12 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SCAPERQ9BY12 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SCAPERQ9BY12 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SCAPERQ9BY12 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SCAPERQ9BY12 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SCAPERQ9BY12 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SCAPERQ9BY12 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SCAPERQ9BY12 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
SCAPERQ9BY12 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
SCAPERQ9BY12 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SCAPERQ9BY12 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SCAPERQ9BY12 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SCAPERQ9BY12 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
SCAPERQ9BY12 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SCAPERQ9BY12 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
SCAPERQ9BY12 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms