Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXL7

CARD11, Caspase recruitment domain-containing protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 1,154 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARD11Q9BXL7 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CARD11Q9BXL7 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CARD11Q9BXL7 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CARD11Q9BXL7 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CARD11Q9BXL7 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CARD11Q9BXL7 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CARD11Q9BXL7 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CARD11Q9BXL7 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CARD11Q9BXL7 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CARD11Q9BXL7 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CARD11Q9BXL7 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CARD11Q9BXL7 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CARD11Q9BXL7 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CARD11Q9BXL7 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CARD11Q9BXL7 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CARD11Q9BXL7 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CARD11Q9BXL7 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CARD11Q9BXL7 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CARD11Q9BXL7 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CARD11Q9BXL7 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CARD11Q9BXL7 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CARD11Q9BXL7 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CARD11Q9BXL7 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CARD11Q9BXL7 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CARD11Q9BXL7 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CARD11Q9BXL7 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CARD11Q9BXL7 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CARD11Q9BXL7 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CARD11Q9BXL7 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CARD11Q9BXL7 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CARD11Q9BXL7 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CARD11Q9BXL7 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CARD11Q9BXL7 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CARD11Q9BXL7 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CARD11Q9BXL7 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CARD11Q9BXL7 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CARD11Q9BXL7 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CARD11Q9BXL7 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CARD11Q9BXL7 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CARD11Q9BXL7 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CARD11Q9BXL7 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CARD11Q9BXL7 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CARD11Q9BXL7 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CARD11Q9BXL7 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CARD11Q9BXL7 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CARD11Q9BXL7 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CARD11Q9BXL7 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CARD11Q9BXL7 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CARD11Q9BXL7 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CARD11Q9BXL7 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CARD11Q9BXL7 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CARD11Q9BXL7 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CARD11Q9BXL7 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CARD11Q9BXL7 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CARD11Q9BXL7 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CARD11Q9BXL7 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CARD11Q9BXL7 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CARD11Q9BXL7 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CARD11Q9BXL7 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CARD11Q9BXL7 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CARD11Q9BXL7 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CARD11Q9BXL7 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CARD11Q9BXL7 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CARD11Q9BXL7 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CARD11Q9BXL7 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CARD11Q9BXL7 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CARD11Q9BXL7 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CARD11Q9BXL7 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CARD11Q9BXL7 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CARD11Q9BXL7 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CARD11Q9BXL7 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CARD11Q9BXL7 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CARD11Q9BXL7 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CARD11Q9BXL7 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CARD11Q9BXL7 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CARD11Q9BXL7 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CARD11Q9BXL7 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CARD11Q9BXL7 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CARD11Q9BXL7 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CARD11Q9BXL7 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CARD11Q9BXL7 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CARD11Q9BXL7 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CARD11Q9BXL7 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CARD11Q9BXL7 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CARD11Q9BXL7 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CARD11Q9BXL7 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CARD11Q9BXL7 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CARD11Q9BXL7 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CARD11Q9BXL7 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CARD11Q9BXL7 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CARD11Q9BXL7 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CARD11Q9BXL7 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CARD11Q9BXL7 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CARD11Q9BXL7 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CARD11Q9BXL7 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CARD11Q9BXL7 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CARD11Q9BXL7 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CARD11Q9BXL7 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CARD11Q9BXL7 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CARD11Q9BXL7 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms