Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXA7

TSSK1B, Testis-specific serine/threonine-protein kinase 1, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSSK1BQ9BXA7 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TSSK1BQ9BXA7 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TSSK1BQ9BXA7 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TSSK1BQ9BXA7 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TSSK1BQ9BXA7 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TSSK1BQ9BXA7 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TSSK1BQ9BXA7 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TSSK1BQ9BXA7 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TSSK1BQ9BXA7 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TSSK1BQ9BXA7 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TSSK1BQ9BXA7 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TSSK1BQ9BXA7 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TSSK1BQ9BXA7 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TSSK1BQ9BXA7 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TSSK1BQ9BXA7 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TSSK1BQ9BXA7 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TSSK1BQ9BXA7 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TSSK1BQ9BXA7 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TSSK1BQ9BXA7 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TSSK1BQ9BXA7 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TSSK1BQ9BXA7 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TSSK1BQ9BXA7 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TSSK1BQ9BXA7 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TSSK1BQ9BXA7 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TSSK1BQ9BXA7 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TSSK1BQ9BXA7 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TSSK1BQ9BXA7 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
TSSK1BQ9BXA7 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TSSK1BQ9BXA7 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TSSK1BQ9BXA7 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TSSK1BQ9BXA7 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TSSK1BQ9BXA7 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TSSK1BQ9BXA7 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TSSK1BQ9BXA7 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TSSK1BQ9BXA7 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TSSK1BQ9BXA7 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TSSK1BQ9BXA7 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TSSK1BQ9BXA7 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TSSK1BQ9BXA7 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TSSK1BQ9BXA7 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TSSK1BQ9BXA7 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TSSK1BQ9BXA7 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TSSK1BQ9BXA7 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TSSK1BQ9BXA7 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TSSK1BQ9BXA7 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TSSK1BQ9BXA7 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TSSK1BQ9BXA7 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TSSK1BQ9BXA7 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TSSK1BQ9BXA7 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TSSK1BQ9BXA7 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TSSK1BQ9BXA7 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TSSK1BQ9BXA7 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
TSSK1BQ9BXA7 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TSSK1BQ9BXA7 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TSSK1BQ9BXA7 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TSSK1BQ9BXA7 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TSSK1BQ9BXA7 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TSSK1BQ9BXA7 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TSSK1BQ9BXA7 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TSSK1BQ9BXA7 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TSSK1BQ9BXA7 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TSSK1BQ9BXA7 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
TSSK1BQ9BXA7 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
TSSK1BQ9BXA7 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TSSK1BQ9BXA7 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TSSK1BQ9BXA7 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TSSK1BQ9BXA7 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TSSK1BQ9BXA7 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TSSK1BQ9BXA7 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TSSK1BQ9BXA7 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TSSK1BQ9BXA7 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TSSK1BQ9BXA7 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TSSK1BQ9BXA7 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TSSK1BQ9BXA7 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TSSK1BQ9BXA7 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
TSSK1BQ9BXA7 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TSSK1BQ9BXA7 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TSSK1BQ9BXA7 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TSSK1BQ9BXA7 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TSSK1BQ9BXA7 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TSSK1BQ9BXA7 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TSSK1BQ9BXA7 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TSSK1BQ9BXA7 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TSSK1BQ9BXA7 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TSSK1BQ9BXA7 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TSSK1BQ9BXA7 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TSSK1BQ9BXA7 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TSSK1BQ9BXA7 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TSSK1BQ9BXA7 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TSSK1BQ9BXA7 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TSSK1BQ9BXA7 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TSSK1BQ9BXA7 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TSSK1BQ9BXA7 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TSSK1BQ9BXA7 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TSSK1BQ9BXA7 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
TSSK1BQ9BXA7 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TSSK1BQ9BXA7 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TSSK1BQ9BXA7 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TSSK1BQ9BXA7 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TSSK1BQ9BXA7 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms