Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWX5

GATA5, Transcription factor GATA-5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATA5Q9BWX5 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GATA5Q9BWX5 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GATA5Q9BWX5 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GATA5Q9BWX5 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GATA5Q9BWX5 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GATA5Q9BWX5 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GATA5Q9BWX5 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GATA5Q9BWX5 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GATA5Q9BWX5 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GATA5Q9BWX5 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GATA5Q9BWX5 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GATA5Q9BWX5 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
GATA5Q9BWX5 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GATA5Q9BWX5 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
GATA5Q9BWX5 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GATA5Q9BWX5 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GATA5Q9BWX5 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
GATA5Q9BWX5 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
GATA5Q9BWX5 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GATA5Q9BWX5 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GATA5Q9BWX5 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GATA5Q9BWX5 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
GATA5Q9BWX5 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GATA5Q9BWX5 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
GATA5Q9BWX5 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GATA5Q9BWX5 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GATA5Q9BWX5 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GATA5Q9BWX5 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GATA5Q9BWX5 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GATA5Q9BWX5 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GATA5Q9BWX5 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GATA5Q9BWX5 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GATA5Q9BWX5 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GATA5Q9BWX5 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GATA5Q9BWX5 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GATA5Q9BWX5 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GATA5Q9BWX5 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GATA5Q9BWX5 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GATA5Q9BWX5 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GATA5Q9BWX5 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GATA5Q9BWX5 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GATA5Q9BWX5 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GATA5Q9BWX5 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GATA5Q9BWX5 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GATA5Q9BWX5 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GATA5Q9BWX5 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GATA5Q9BWX5 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GATA5Q9BWX5 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GATA5Q9BWX5 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GATA5Q9BWX5 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GATA5Q9BWX5 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GATA5Q9BWX5 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GATA5Q9BWX5 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GATA5Q9BWX5 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GATA5Q9BWX5 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GATA5Q9BWX5 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
GATA5Q9BWX5 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GATA5Q9BWX5 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
GATA5Q9BWX5 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GATA5Q9BWX5 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GATA5Q9BWX5 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GATA5Q9BWX5 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GATA5Q9BWX5 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GATA5Q9BWX5 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GATA5Q9BWX5 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GATA5Q9BWX5 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GATA5Q9BWX5 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GATA5Q9BWX5 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GATA5Q9BWX5 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
GATA5Q9BWX5 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
GATA5Q9BWX5 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
GATA5Q9BWX5 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GATA5Q9BWX5 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GATA5Q9BWX5 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
GATA5Q9BWX5 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GATA5Q9BWX5 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GATA5Q9BWX5 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GATA5Q9BWX5 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GATA5Q9BWX5 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
GATA5Q9BWX5 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GATA5Q9BWX5 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GATA5Q9BWX5 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GATA5Q9BWX5 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GATA5Q9BWX5 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GATA5Q9BWX5 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GATA5Q9BWX5 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GATA5Q9BWX5 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GATA5Q9BWX5 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GATA5Q9BWX5 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GATA5Q9BWX5 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GATA5Q9BWX5 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GATA5Q9BWX5 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
GATA5Q9BWX5 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GATA5Q9BWX5 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GATA5Q9BWX5 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GATA5Q9BWX5 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GATA5Q9BWX5 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GATA5Q9BWX5 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GATA5Q9BWX5 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GATA5Q9BWX5 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms