Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUW7

C9orf16, UPF0184 protein C9orf16, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf16Q9BUW7 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
C9orf16Q9BUW7 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
C9orf16Q9BUW7 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
C9orf16Q9BUW7 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
C9orf16Q9BUW7 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
C9orf16Q9BUW7 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
C9orf16Q9BUW7 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
C9orf16Q9BUW7 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
C9orf16Q9BUW7 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
C9orf16Q9BUW7 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
C9orf16Q9BUW7 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
C9orf16Q9BUW7 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
C9orf16Q9BUW7 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
C9orf16Q9BUW7 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
C9orf16Q9BUW7 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
C9orf16Q9BUW7 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
C9orf16Q9BUW7 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
C9orf16Q9BUW7 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
C9orf16Q9BUW7 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
C9orf16Q9BUW7 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
C9orf16Q9BUW7 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
C9orf16Q9BUW7 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
C9orf16Q9BUW7 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
C9orf16Q9BUW7 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
C9orf16Q9BUW7 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
C9orf16Q9BUW7 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
C9orf16Q9BUW7 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
C9orf16Q9BUW7 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
C9orf16Q9BUW7 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
C9orf16Q9BUW7 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
C9orf16Q9BUW7 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
C9orf16Q9BUW7 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
C9orf16Q9BUW7 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
C9orf16Q9BUW7 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
C9orf16Q9BUW7 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
C9orf16Q9BUW7 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
C9orf16Q9BUW7 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
C9orf16Q9BUW7 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
C9orf16Q9BUW7 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
C9orf16Q9BUW7 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
C9orf16Q9BUW7 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
C9orf16Q9BUW7 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
C9orf16Q9BUW7 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
C9orf16Q9BUW7 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
C9orf16Q9BUW7 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC15.69■□□□□ 0.1
C9orf16Q9BUW7 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC15.69■□□□□ 0.1
C9orf16Q9BUW7 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
C9orf16Q9BUW7 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
C9orf16Q9BUW7 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
C9orf16Q9BUW7 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
C9orf16Q9BUW7 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
C9orf16Q9BUW7 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
C9orf16Q9BUW7 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
C9orf16Q9BUW7 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
C9orf16Q9BUW7 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
C9orf16Q9BUW7 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
C9orf16Q9BUW7 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
C9orf16Q9BUW7 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
C9orf16Q9BUW7 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
C9orf16Q9BUW7 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
C9orf16Q9BUW7 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
C9orf16Q9BUW7 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
C9orf16Q9BUW7 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
C9orf16Q9BUW7 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
C9orf16Q9BUW7 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
C9orf16Q9BUW7 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
C9orf16Q9BUW7 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
C9orf16Q9BUW7 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
C9orf16Q9BUW7 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
C9orf16Q9BUW7 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
C9orf16Q9BUW7 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
C9orf16Q9BUW7 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
C9orf16Q9BUW7 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
C9orf16Q9BUW7 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
C9orf16Q9BUW7 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
C9orf16Q9BUW7 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
C9orf16Q9BUW7 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
C9orf16Q9BUW7 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
C9orf16Q9BUW7 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
C9orf16Q9BUW7 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
C9orf16Q9BUW7 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
C9orf16Q9BUW7 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
C9orf16Q9BUW7 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
C9orf16Q9BUW7 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
C9orf16Q9BUW7 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
C9orf16Q9BUW7 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
C9orf16Q9BUW7 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
C9orf16Q9BUW7 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
C9orf16Q9BUW7 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
C9orf16Q9BUW7 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
C9orf16Q9BUW7 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
C9orf16Q9BUW7 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
C9orf16Q9BUW7 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
C9orf16Q9BUW7 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
C9orf16Q9BUW7 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
C9orf16Q9BUW7 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
C9orf16Q9BUW7 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
C9orf16Q9BUW7 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
C9orf16Q9BUW7 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
C9orf16Q9BUW7 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.3 ms