Protein–RNA interactions for Protein: Q99417

MYCBP, c-Myc-binding protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 103 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYCBPQ99417 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
MYCBPQ99417 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MYCBPQ99417 AC113189.2-201ENST00000575310 1975 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
MYCBPQ99417 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MYCBPQ99417 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MYCBPQ99417 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MYCBPQ99417 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MYCBPQ99417 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MYCBPQ99417 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MYCBPQ99417 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MYCBPQ99417 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
MYCBPQ99417 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MYCBPQ99417 RASGEF1A-202ENST00000374459 3264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
MYCBPQ99417 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MYCBPQ99417 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MYCBPQ99417 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MYCBPQ99417 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
MYCBPQ99417 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MYCBPQ99417 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
MYCBPQ99417 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MYCBPQ99417 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MYCBPQ99417 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
MYCBPQ99417 HNRNPH1-204ENST00000442819 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MYCBPQ99417 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
MYCBPQ99417 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MYCBPQ99417 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
MYCBPQ99417 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
MYCBPQ99417 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
MYCBPQ99417 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
MYCBPQ99417 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
MYCBPQ99417 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
MYCBPQ99417 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
MYCBPQ99417 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MYCBPQ99417 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
MYCBPQ99417 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
MYCBPQ99417 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
MYCBPQ99417 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
MYCBPQ99417 PPM1A-203ENST00000395076 8184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MYCBPQ99417 SYCP2L-201ENST00000283141 3130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MYCBPQ99417 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
MYCBPQ99417 FBXO3-203ENST00000526785 5798 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MYCBPQ99417 MYD88-203ENST00000417037 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MYCBPQ99417 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
MYCBPQ99417 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MYCBPQ99417 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
MYCBPQ99417 NRROS-201ENST00000328557 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MYCBPQ99417 CD34-203ENST00000367036 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MYCBPQ99417 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MYCBPQ99417 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
MYCBPQ99417 SERPINA4-203ENST00000557004 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MYCBPQ99417 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MYCBPQ99417 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MYCBPQ99417 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MYCBPQ99417 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MYCBPQ99417 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MYCBPQ99417 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MYCBPQ99417 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
MYCBPQ99417 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MYCBPQ99417 NALCN-AS1-201ENST00000457843 2846 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
MYCBPQ99417 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
MYCBPQ99417 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
MYCBPQ99417 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
MYCBPQ99417 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
MYCBPQ99417 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
MYCBPQ99417 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
MYCBPQ99417 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
MYCBPQ99417 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
MYCBPQ99417 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
MYCBPQ99417 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MYCBPQ99417 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
MYCBPQ99417 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MYCBPQ99417 HBP1-212ENST00000485846 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
MYCBPQ99417 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
MYCBPQ99417 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
MYCBPQ99417 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MYCBPQ99417 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MYCBPQ99417 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
MYCBPQ99417 RBM6-201ENST00000266022 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MYCBPQ99417 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MYCBPQ99417 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
MYCBPQ99417 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MYCBPQ99417 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MYCBPQ99417 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MYCBPQ99417 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
MYCBPQ99417 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MYCBPQ99417 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MYCBPQ99417 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
MYCBPQ99417 ADAR-202ENST00000368474 6625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
MYCBPQ99417 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
MYCBPQ99417 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
MYCBPQ99417 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
MYCBPQ99417 STK3-201ENST00000419617 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
MYCBPQ99417 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
MYCBPQ99417 DBN1-203ENST00000393565 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
MYCBPQ99417 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
MYCBPQ99417 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
MYCBPQ99417 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
MYCBPQ99417 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
MYCBPQ99417 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
MYCBPQ99417 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.2 ms