Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT4

SAMD8, Sphingomyelin synthase-related protein 1, humanhuman

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD8Q96LT4 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SAMD8Q96LT4 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SAMD8Q96LT4 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SAMD8Q96LT4 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SAMD8Q96LT4 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SAMD8Q96LT4 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SAMD8Q96LT4 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SAMD8Q96LT4 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SAMD8Q96LT4 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SAMD8Q96LT4 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SAMD8Q96LT4 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SAMD8Q96LT4 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SAMD8Q96LT4 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SAMD8Q96LT4 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SAMD8Q96LT4 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SAMD8Q96LT4 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SAMD8Q96LT4 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SAMD8Q96LT4 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SAMD8Q96LT4 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SAMD8Q96LT4 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SAMD8Q96LT4 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SAMD8Q96LT4 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SAMD8Q96LT4 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SAMD8Q96LT4 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SAMD8Q96LT4 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SAMD8Q96LT4 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SAMD8Q96LT4 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SAMD8Q96LT4 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SAMD8Q96LT4 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SAMD8Q96LT4 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SAMD8Q96LT4 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SAMD8Q96LT4 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SAMD8Q96LT4 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SAMD8Q96LT4 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SAMD8Q96LT4 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SAMD8Q96LT4 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SAMD8Q96LT4 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SAMD8Q96LT4 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SAMD8Q96LT4 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SAMD8Q96LT4 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SAMD8Q96LT4 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SAMD8Q96LT4 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SAMD8Q96LT4 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SAMD8Q96LT4 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SAMD8Q96LT4 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SAMD8Q96LT4 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SAMD8Q96LT4 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SAMD8Q96LT4 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SAMD8Q96LT4 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SAMD8Q96LT4 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SAMD8Q96LT4 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
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SAMD8Q96LT4 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
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SAMD8Q96LT4 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SAMD8Q96LT4 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SAMD8Q96LT4 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SAMD8Q96LT4 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
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SAMD8Q96LT4 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SAMD8Q96LT4 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SAMD8Q96LT4 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SAMD8Q96LT4 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
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SAMD8Q96LT4 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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SAMD8Q96LT4 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SAMD8Q96LT4 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SAMD8Q96LT4 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SAMD8Q96LT4 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SAMD8Q96LT4 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SAMD8Q96LT4 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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SAMD8Q96LT4 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SAMD8Q96LT4 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SAMD8Q96LT4 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SAMD8Q96LT4 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SAMD8Q96LT4 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SAMD8Q96LT4 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
SAMD8Q96LT4 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SAMD8Q96LT4 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SAMD8Q96LT4 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SAMD8Q96LT4 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SAMD8Q96LT4 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SAMD8Q96LT4 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SAMD8Q96LT4 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SAMD8Q96LT4 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SAMD8Q96LT4 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SAMD8Q96LT4 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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