Protein–RNA interactions for Protein: Q96K76

USP47, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 47, humanhuman

Predictions only

Length 1,375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP47Q96K76 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
USP47Q96K76 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
USP47Q96K76 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.32
USP47Q96K76 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
USP47Q96K76 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
USP47Q96K76 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
USP47Q96K76 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
USP47Q96K76 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
USP47Q96K76 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
USP47Q96K76 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
USP47Q96K76 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
USP47Q96K76 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
USP47Q96K76 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
USP47Q96K76 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
USP47Q96K76 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
USP47Q96K76 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
USP47Q96K76 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
USP47Q96K76 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
USP47Q96K76 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
USP47Q96K76 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
USP47Q96K76 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
USP47Q96K76 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
USP47Q96K76 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
USP47Q96K76 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
USP47Q96K76 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
USP47Q96K76 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
USP47Q96K76 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
USP47Q96K76 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
USP47Q96K76 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
USP47Q96K76 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
USP47Q96K76 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
USP47Q96K76 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
USP47Q96K76 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
USP47Q96K76 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
USP47Q96K76 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
USP47Q96K76 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
USP47Q96K76 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
USP47Q96K76 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
USP47Q96K76 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
USP47Q96K76 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
USP47Q96K76 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
USP47Q96K76 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
USP47Q96K76 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
USP47Q96K76 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
USP47Q96K76 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
USP47Q96K76 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
USP47Q96K76 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
USP47Q96K76 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
USP47Q96K76 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
USP47Q96K76 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
USP47Q96K76 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
USP47Q96K76 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
USP47Q96K76 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
USP47Q96K76 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
USP47Q96K76 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
USP47Q96K76 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
USP47Q96K76 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
USP47Q96K76 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
USP47Q96K76 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
USP47Q96K76 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
USP47Q96K76 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
USP47Q96K76 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
USP47Q96K76 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
USP47Q96K76 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
USP47Q96K76 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
USP47Q96K76 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
USP47Q96K76 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
USP47Q96K76 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
USP47Q96K76 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
USP47Q96K76 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
USP47Q96K76 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
USP47Q96K76 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
USP47Q96K76 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
USP47Q96K76 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
USP47Q96K76 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
USP47Q96K76 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
USP47Q96K76 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
USP47Q96K76 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
USP47Q96K76 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
USP47Q96K76 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
USP47Q96K76 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
USP47Q96K76 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
USP47Q96K76 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
USP47Q96K76 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
USP47Q96K76 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
USP47Q96K76 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
USP47Q96K76 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
USP47Q96K76 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
USP47Q96K76 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
USP47Q96K76 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
USP47Q96K76 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
USP47Q96K76 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
USP47Q96K76 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
USP47Q96K76 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
USP47Q96K76 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
USP47Q96K76 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
USP47Q96K76 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
USP47Q96K76 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
USP47Q96K76 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
USP47Q96K76 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms