Protein–RNA interactions for Protein: Q96DM3

C18orf8, Uncharacterized protein C18orf8, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C18orf8Q96DM3 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
C18orf8Q96DM3 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
C18orf8Q96DM3 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
C18orf8Q96DM3 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
C18orf8Q96DM3 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
C18orf8Q96DM3 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
C18orf8Q96DM3 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
C18orf8Q96DM3 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
C18orf8Q96DM3 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
C18orf8Q96DM3 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
C18orf8Q96DM3 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
C18orf8Q96DM3 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
C18orf8Q96DM3 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
C18orf8Q96DM3 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
C18orf8Q96DM3 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
C18orf8Q96DM3 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
C18orf8Q96DM3 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
C18orf8Q96DM3 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
C18orf8Q96DM3 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
C18orf8Q96DM3 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
C18orf8Q96DM3 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
C18orf8Q96DM3 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
C18orf8Q96DM3 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
C18orf8Q96DM3 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
C18orf8Q96DM3 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
C18orf8Q96DM3 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
C18orf8Q96DM3 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
C18orf8Q96DM3 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
C18orf8Q96DM3 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
C18orf8Q96DM3 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
C18orf8Q96DM3 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
C18orf8Q96DM3 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
C18orf8Q96DM3 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
C18orf8Q96DM3 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
C18orf8Q96DM3 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
C18orf8Q96DM3 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
C18orf8Q96DM3 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
C18orf8Q96DM3 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
C18orf8Q96DM3 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
C18orf8Q96DM3 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
C18orf8Q96DM3 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
C18orf8Q96DM3 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
C18orf8Q96DM3 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
C18orf8Q96DM3 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
C18orf8Q96DM3 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
C18orf8Q96DM3 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
C18orf8Q96DM3 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
C18orf8Q96DM3 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
C18orf8Q96DM3 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
C18orf8Q96DM3 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
C18orf8Q96DM3 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
C18orf8Q96DM3 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
C18orf8Q96DM3 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
C18orf8Q96DM3 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
C18orf8Q96DM3 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
C18orf8Q96DM3 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
C18orf8Q96DM3 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
C18orf8Q96DM3 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
C18orf8Q96DM3 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
C18orf8Q96DM3 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
C18orf8Q96DM3 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
C18orf8Q96DM3 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
C18orf8Q96DM3 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
C18orf8Q96DM3 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
C18orf8Q96DM3 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
C18orf8Q96DM3 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
C18orf8Q96DM3 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
C18orf8Q96DM3 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
C18orf8Q96DM3 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
C18orf8Q96DM3 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
C18orf8Q96DM3 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
C18orf8Q96DM3 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
C18orf8Q96DM3 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
C18orf8Q96DM3 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
C18orf8Q96DM3 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
C18orf8Q96DM3 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
C18orf8Q96DM3 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
C18orf8Q96DM3 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
C18orf8Q96DM3 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
C18orf8Q96DM3 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
C18orf8Q96DM3 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
C18orf8Q96DM3 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
C18orf8Q96DM3 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
C18orf8Q96DM3 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
C18orf8Q96DM3 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
C18orf8Q96DM3 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
C18orf8Q96DM3 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
C18orf8Q96DM3 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
C18orf8Q96DM3 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
C18orf8Q96DM3 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
C18orf8Q96DM3 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
C18orf8Q96DM3 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
C18orf8Q96DM3 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
C18orf8Q96DM3 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
C18orf8Q96DM3 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
C18orf8Q96DM3 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
C18orf8Q96DM3 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
C18orf8Q96DM3 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
C18orf8Q96DM3 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
C18orf8Q96DM3 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms