Protein–RNA interactions for Protein: Q96CG8

CTHRC1, Collagen triple helix repeat-containing protein 1, humanhuman

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Length 243 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTHRC1Q96CG8 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTHRC1Q96CG8 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTHRC1Q96CG8 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CTHRC1Q96CG8 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CTHRC1Q96CG8 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTHRC1Q96CG8 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTHRC1Q96CG8 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTHRC1Q96CG8 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTHRC1Q96CG8 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTHRC1Q96CG8 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTHRC1Q96CG8 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTHRC1Q96CG8 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTHRC1Q96CG8 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTHRC1Q96CG8 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTHRC1Q96CG8 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTHRC1Q96CG8 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTHRC1Q96CG8 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTHRC1Q96CG8 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTHRC1Q96CG8 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTHRC1Q96CG8 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CTHRC1Q96CG8 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTHRC1Q96CG8 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CTHRC1Q96CG8 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTHRC1Q96CG8 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTHRC1Q96CG8 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTHRC1Q96CG8 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTHRC1Q96CG8 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTHRC1Q96CG8 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTHRC1Q96CG8 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTHRC1Q96CG8 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTHRC1Q96CG8 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTHRC1Q96CG8 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTHRC1Q96CG8 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTHRC1Q96CG8 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTHRC1Q96CG8 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTHRC1Q96CG8 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTHRC1Q96CG8 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTHRC1Q96CG8 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CTHRC1Q96CG8 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTHRC1Q96CG8 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTHRC1Q96CG8 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTHRC1Q96CG8 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTHRC1Q96CG8 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTHRC1Q96CG8 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTHRC1Q96CG8 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CTHRC1Q96CG8 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTHRC1Q96CG8 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTHRC1Q96CG8 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTHRC1Q96CG8 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTHRC1Q96CG8 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTHRC1Q96CG8 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTHRC1Q96CG8 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTHRC1Q96CG8 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTHRC1Q96CG8 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTHRC1Q96CG8 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTHRC1Q96CG8 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTHRC1Q96CG8 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTHRC1Q96CG8 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTHRC1Q96CG8 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CTHRC1Q96CG8 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTHRC1Q96CG8 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTHRC1Q96CG8 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTHRC1Q96CG8 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTHRC1Q96CG8 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTHRC1Q96CG8 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTHRC1Q96CG8 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTHRC1Q96CG8 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTHRC1Q96CG8 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTHRC1Q96CG8 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CTHRC1Q96CG8 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTHRC1Q96CG8 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CTHRC1Q96CG8 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTHRC1Q96CG8 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTHRC1Q96CG8 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTHRC1Q96CG8 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTHRC1Q96CG8 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTHRC1Q96CG8 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTHRC1Q96CG8 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CTHRC1Q96CG8 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTHRC1Q96CG8 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTHRC1Q96CG8 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTHRC1Q96CG8 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTHRC1Q96CG8 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTHRC1Q96CG8 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTHRC1Q96CG8 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTHRC1Q96CG8 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTHRC1Q96CG8 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTHRC1Q96CG8 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTHRC1Q96CG8 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTHRC1Q96CG8 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTHRC1Q96CG8 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTHRC1Q96CG8 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTHRC1Q96CG8 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTHRC1Q96CG8 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTHRC1Q96CG8 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTHRC1Q96CG8 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTHRC1Q96CG8 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTHRC1Q96CG8 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CTHRC1Q96CG8 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTHRC1Q96CG8 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
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