Protein–RNA interactions for Protein: Q969X6

UTP4, U3 small nucleolar RNA-associated protein 4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 686 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP4Q969X6 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
UTP4Q969X6 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
UTP4Q969X6 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
UTP4Q969X6 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
UTP4Q969X6 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
UTP4Q969X6 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
UTP4Q969X6 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
UTP4Q969X6 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
UTP4Q969X6 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
UTP4Q969X6 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
UTP4Q969X6 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
UTP4Q969X6 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
UTP4Q969X6 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
UTP4Q969X6 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
UTP4Q969X6 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
UTP4Q969X6 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
UTP4Q969X6 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
UTP4Q969X6 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
UTP4Q969X6 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
UTP4Q969X6 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
UTP4Q969X6 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
UTP4Q969X6 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UTP4Q969X6 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UTP4Q969X6 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UTP4Q969X6 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UTP4Q969X6 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
UTP4Q969X6 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
UTP4Q969X6 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UTP4Q969X6 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UTP4Q969X6 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
UTP4Q969X6 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UTP4Q969X6 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UTP4Q969X6 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UTP4Q969X6 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UTP4Q969X6 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
UTP4Q969X6 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
UTP4Q969X6 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
UTP4Q969X6 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
UTP4Q969X6 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
UTP4Q969X6 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
UTP4Q969X6 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
UTP4Q969X6 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UTP4Q969X6 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
UTP4Q969X6 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UTP4Q969X6 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UTP4Q969X6 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
UTP4Q969X6 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UTP4Q969X6 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UTP4Q969X6 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
UTP4Q969X6 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UTP4Q969X6 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
UTP4Q969X6 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UTP4Q969X6 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UTP4Q969X6 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UTP4Q969X6 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UTP4Q969X6 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UTP4Q969X6 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UTP4Q969X6 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
UTP4Q969X6 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
UTP4Q969X6 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
UTP4Q969X6 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
UTP4Q969X6 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
UTP4Q969X6 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
UTP4Q969X6 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
UTP4Q969X6 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
UTP4Q969X6 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
UTP4Q969X6 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
UTP4Q969X6 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
UTP4Q969X6 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
UTP4Q969X6 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
UTP4Q969X6 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
UTP4Q969X6 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
UTP4Q969X6 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
UTP4Q969X6 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
UTP4Q969X6 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
UTP4Q969X6 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
UTP4Q969X6 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
UTP4Q969X6 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
UTP4Q969X6 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UTP4Q969X6 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
UTP4Q969X6 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UTP4Q969X6 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UTP4Q969X6 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
UTP4Q969X6 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UTP4Q969X6 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UTP4Q969X6 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
UTP4Q969X6 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
UTP4Q969X6 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
UTP4Q969X6 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
UTP4Q969X6 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
UTP4Q969X6 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
UTP4Q969X6 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UTP4Q969X6 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UTP4Q969X6 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
UTP4Q969X6 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UTP4Q969X6 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UTP4Q969X6 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
UTP4Q969X6 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UTP4Q969X6 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UTP4Q969X6 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.3 ms