Protein–RNA interactions for Protein: Q969G5

CAVIN3, Caveolae-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN3Q969G5 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CAVIN3Q969G5 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CAVIN3Q969G5 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CAVIN3Q969G5 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CAVIN3Q969G5 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CAVIN3Q969G5 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CAVIN3Q969G5 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CAVIN3Q969G5 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CAVIN3Q969G5 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CAVIN3Q969G5 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CAVIN3Q969G5 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CAVIN3Q969G5 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CAVIN3Q969G5 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CAVIN3Q969G5 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CAVIN3Q969G5 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CAVIN3Q969G5 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CAVIN3Q969G5 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CAVIN3Q969G5 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CAVIN3Q969G5 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CAVIN3Q969G5 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CAVIN3Q969G5 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CAVIN3Q969G5 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CAVIN3Q969G5 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CAVIN3Q969G5 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CAVIN3Q969G5 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CAVIN3Q969G5 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CAVIN3Q969G5 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CAVIN3Q969G5 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CAVIN3Q969G5 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CAVIN3Q969G5 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CAVIN3Q969G5 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CAVIN3Q969G5 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CAVIN3Q969G5 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CAVIN3Q969G5 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CAVIN3Q969G5 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CAVIN3Q969G5 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CAVIN3Q969G5 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CAVIN3Q969G5 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CAVIN3Q969G5 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CAVIN3Q969G5 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CAVIN3Q969G5 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CAVIN3Q969G5 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CAVIN3Q969G5 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CAVIN3Q969G5 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CAVIN3Q969G5 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CAVIN3Q969G5 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CAVIN3Q969G5 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CAVIN3Q969G5 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CAVIN3Q969G5 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CAVIN3Q969G5 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CAVIN3Q969G5 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CAVIN3Q969G5 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CAVIN3Q969G5 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CAVIN3Q969G5 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CAVIN3Q969G5 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CAVIN3Q969G5 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CAVIN3Q969G5 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CAVIN3Q969G5 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CAVIN3Q969G5 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CAVIN3Q969G5 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CAVIN3Q969G5 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CAVIN3Q969G5 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CAVIN3Q969G5 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CAVIN3Q969G5 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CAVIN3Q969G5 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CAVIN3Q969G5 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CAVIN3Q969G5 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CAVIN3Q969G5 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CAVIN3Q969G5 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CAVIN3Q969G5 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CAVIN3Q969G5 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
CAVIN3Q969G5 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
CAVIN3Q969G5 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CAVIN3Q969G5 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CAVIN3Q969G5 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CAVIN3Q969G5 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CAVIN3Q969G5 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.34
CAVIN3Q969G5 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.34
CAVIN3Q969G5 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CAVIN3Q969G5 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CAVIN3Q969G5 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CAVIN3Q969G5 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CAVIN3Q969G5 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CAVIN3Q969G5 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CAVIN3Q969G5 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CAVIN3Q969G5 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CAVIN3Q969G5 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CAVIN3Q969G5 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CAVIN3Q969G5 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CAVIN3Q969G5 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CAVIN3Q969G5 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CAVIN3Q969G5 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CAVIN3Q969G5 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CAVIN3Q969G5 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CAVIN3Q969G5 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CAVIN3Q969G5 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CAVIN3Q969G5 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CAVIN3Q969G5 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CAVIN3Q969G5 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CAVIN3Q969G5 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms