Protein–RNA interactions for Protein: Q8TAL5

C9orf43, Uncharacterized protein C9orf43, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf43Q8TAL5 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C9orf43Q8TAL5 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C9orf43Q8TAL5 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C9orf43Q8TAL5 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C9orf43Q8TAL5 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C9orf43Q8TAL5 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C9orf43Q8TAL5 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C9orf43Q8TAL5 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C9orf43Q8TAL5 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
C9orf43Q8TAL5 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C9orf43Q8TAL5 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C9orf43Q8TAL5 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C9orf43Q8TAL5 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C9orf43Q8TAL5 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C9orf43Q8TAL5 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C9orf43Q8TAL5 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C9orf43Q8TAL5 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C9orf43Q8TAL5 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C9orf43Q8TAL5 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C9orf43Q8TAL5 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C9orf43Q8TAL5 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C9orf43Q8TAL5 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C9orf43Q8TAL5 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C9orf43Q8TAL5 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
C9orf43Q8TAL5 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C9orf43Q8TAL5 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C9orf43Q8TAL5 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C9orf43Q8TAL5 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C9orf43Q8TAL5 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C9orf43Q8TAL5 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C9orf43Q8TAL5 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C9orf43Q8TAL5 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C9orf43Q8TAL5 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
C9orf43Q8TAL5 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C9orf43Q8TAL5 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C9orf43Q8TAL5 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C9orf43Q8TAL5 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C9orf43Q8TAL5 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C9orf43Q8TAL5 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C9orf43Q8TAL5 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C9orf43Q8TAL5 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
C9orf43Q8TAL5 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C9orf43Q8TAL5 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C9orf43Q8TAL5 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C9orf43Q8TAL5 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C9orf43Q8TAL5 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
C9orf43Q8TAL5 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
C9orf43Q8TAL5 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
C9orf43Q8TAL5 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
C9orf43Q8TAL5 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
C9orf43Q8TAL5 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
C9orf43Q8TAL5 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
C9orf43Q8TAL5 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
C9orf43Q8TAL5 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
C9orf43Q8TAL5 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
C9orf43Q8TAL5 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
C9orf43Q8TAL5 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
C9orf43Q8TAL5 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C9orf43Q8TAL5 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C9orf43Q8TAL5 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C9orf43Q8TAL5 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C9orf43Q8TAL5 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C9orf43Q8TAL5 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C9orf43Q8TAL5 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C9orf43Q8TAL5 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C9orf43Q8TAL5 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
C9orf43Q8TAL5 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C9orf43Q8TAL5 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C9orf43Q8TAL5 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
C9orf43Q8TAL5 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C9orf43Q8TAL5 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C9orf43Q8TAL5 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C9orf43Q8TAL5 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C9orf43Q8TAL5 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C9orf43Q8TAL5 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C9orf43Q8TAL5 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C9orf43Q8TAL5 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C9orf43Q8TAL5 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C9orf43Q8TAL5 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C9orf43Q8TAL5 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C9orf43Q8TAL5 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C9orf43Q8TAL5 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C9orf43Q8TAL5 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C9orf43Q8TAL5 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C9orf43Q8TAL5 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C9orf43Q8TAL5 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C9orf43Q8TAL5 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C9orf43Q8TAL5 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C9orf43Q8TAL5 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C9orf43Q8TAL5 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C9orf43Q8TAL5 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C9orf43Q8TAL5 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C9orf43Q8TAL5 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C9orf43Q8TAL5 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C9orf43Q8TAL5 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C9orf43Q8TAL5 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C9orf43Q8TAL5 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C9orf43Q8TAL5 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C9orf43Q8TAL5 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C9orf43Q8TAL5 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.8 ms