Protein–RNA interactions for Protein: Q86WV1

SKAP1, Src kinase-associated phosphoprotein 1, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP1Q86WV1 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SKAP1Q86WV1 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SKAP1Q86WV1 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SKAP1Q86WV1 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SKAP1Q86WV1 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SKAP1Q86WV1 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SKAP1Q86WV1 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SKAP1Q86WV1 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SKAP1Q86WV1 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SKAP1Q86WV1 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SKAP1Q86WV1 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SKAP1Q86WV1 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SKAP1Q86WV1 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SKAP1Q86WV1 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SKAP1Q86WV1 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SKAP1Q86WV1 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SKAP1Q86WV1 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SKAP1Q86WV1 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SKAP1Q86WV1 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SKAP1Q86WV1 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SKAP1Q86WV1 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SKAP1Q86WV1 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SKAP1Q86WV1 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SKAP1Q86WV1 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SKAP1Q86WV1 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SKAP1Q86WV1 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SKAP1Q86WV1 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
SKAP1Q86WV1 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SKAP1Q86WV1 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SKAP1Q86WV1 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SKAP1Q86WV1 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SKAP1Q86WV1 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SKAP1Q86WV1 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SKAP1Q86WV1 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SKAP1Q86WV1 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SKAP1Q86WV1 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SKAP1Q86WV1 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SKAP1Q86WV1 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SKAP1Q86WV1 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
SKAP1Q86WV1 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SKAP1Q86WV1 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SKAP1Q86WV1 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SKAP1Q86WV1 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SKAP1Q86WV1 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SKAP1Q86WV1 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SKAP1Q86WV1 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SKAP1Q86WV1 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SKAP1Q86WV1 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SKAP1Q86WV1 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SKAP1Q86WV1 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SKAP1Q86WV1 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SKAP1Q86WV1 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SKAP1Q86WV1 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SKAP1Q86WV1 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SKAP1Q86WV1 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SKAP1Q86WV1 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SKAP1Q86WV1 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SKAP1Q86WV1 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SKAP1Q86WV1 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SKAP1Q86WV1 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SKAP1Q86WV1 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SKAP1Q86WV1 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SKAP1Q86WV1 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SKAP1Q86WV1 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SKAP1Q86WV1 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SKAP1Q86WV1 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SKAP1Q86WV1 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SKAP1Q86WV1 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SKAP1Q86WV1 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SKAP1Q86WV1 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SKAP1Q86WV1 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SKAP1Q86WV1 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SKAP1Q86WV1 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SKAP1Q86WV1 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SKAP1Q86WV1 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
SKAP1Q86WV1 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SKAP1Q86WV1 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SKAP1Q86WV1 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SKAP1Q86WV1 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SKAP1Q86WV1 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SKAP1Q86WV1 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
SKAP1Q86WV1 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SKAP1Q86WV1 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SKAP1Q86WV1 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SKAP1Q86WV1 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SKAP1Q86WV1 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SKAP1Q86WV1 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SKAP1Q86WV1 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SKAP1Q86WV1 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SKAP1Q86WV1 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SKAP1Q86WV1 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SKAP1Q86WV1 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SKAP1Q86WV1 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SKAP1Q86WV1 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SKAP1Q86WV1 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SKAP1Q86WV1 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SKAP1Q86WV1 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SKAP1Q86WV1 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SKAP1Q86WV1 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SKAP1Q86WV1 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms