Protein–RNA interactions for Protein: Q86UT8

CCDC84, Coiled-coil domain-containing protein 84, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC84Q86UT8 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC84Q86UT8 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC84Q86UT8 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC84Q86UT8 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC84Q86UT8 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC84Q86UT8 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC84Q86UT8 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC84Q86UT8 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC84Q86UT8 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC84Q86UT8 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC84Q86UT8 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC84Q86UT8 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC84Q86UT8 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC84Q86UT8 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC84Q86UT8 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC84Q86UT8 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CCDC84Q86UT8 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CCDC84Q86UT8 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CCDC84Q86UT8 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CCDC84Q86UT8 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CCDC84Q86UT8 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CCDC84Q86UT8 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CCDC84Q86UT8 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CCDC84Q86UT8 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CCDC84Q86UT8 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CCDC84Q86UT8 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CCDC84Q86UT8 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CCDC84Q86UT8 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CCDC84Q86UT8 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CCDC84Q86UT8 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCDC84Q86UT8 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCDC84Q86UT8 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
CCDC84Q86UT8 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
CCDC84Q86UT8 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
CCDC84Q86UT8 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
CCDC84Q86UT8 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
CCDC84Q86UT8 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCDC84Q86UT8 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCDC84Q86UT8 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCDC84Q86UT8 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCDC84Q86UT8 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCDC84Q86UT8 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCDC84Q86UT8 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCDC84Q86UT8 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCDC84Q86UT8 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCDC84Q86UT8 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
CCDC84Q86UT8 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCDC84Q86UT8 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCDC84Q86UT8 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCDC84Q86UT8 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC84Q86UT8 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC84Q86UT8 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC84Q86UT8 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC84Q86UT8 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC84Q86UT8 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC84Q86UT8 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC84Q86UT8 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC84Q86UT8 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC84Q86UT8 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC84Q86UT8 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC84Q86UT8 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC84Q86UT8 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC84Q86UT8 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC84Q86UT8 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC84Q86UT8 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC84Q86UT8 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC84Q86UT8 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC84Q86UT8 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC84Q86UT8 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC84Q86UT8 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC84Q86UT8 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC84Q86UT8 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC84Q86UT8 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC84Q86UT8 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC84Q86UT8 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC84Q86UT8 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC84Q86UT8 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC84Q86UT8 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC84Q86UT8 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC84Q86UT8 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC84Q86UT8 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC84Q86UT8 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC84Q86UT8 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC84Q86UT8 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC84Q86UT8 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC84Q86UT8 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC84Q86UT8 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC84Q86UT8 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC84Q86UT8 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC84Q86UT8 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC84Q86UT8 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC84Q86UT8 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC84Q86UT8 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC84Q86UT8 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC84Q86UT8 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC84Q86UT8 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC84Q86UT8 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC84Q86UT8 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC84Q86UT8 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC84Q86UT8 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.6 ms