Protein–RNA interactions for Protein: Q6STE5

SMARCD3, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily D member 3, humanhuman

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCD3Q6STE5 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMARCD3Q6STE5 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMARCD3Q6STE5 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMARCD3Q6STE5 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMARCD3Q6STE5 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMARCD3Q6STE5 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMARCD3Q6STE5 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMARCD3Q6STE5 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMARCD3Q6STE5 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMARCD3Q6STE5 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMARCD3Q6STE5 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMARCD3Q6STE5 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMARCD3Q6STE5 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMARCD3Q6STE5 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMARCD3Q6STE5 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SMARCD3Q6STE5 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMARCD3Q6STE5 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SMARCD3Q6STE5 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SMARCD3Q6STE5 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMARCD3Q6STE5 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMARCD3Q6STE5 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMARCD3Q6STE5 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SMARCD3Q6STE5 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMARCD3Q6STE5 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMARCD3Q6STE5 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMARCD3Q6STE5 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMARCD3Q6STE5 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMARCD3Q6STE5 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMARCD3Q6STE5 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMARCD3Q6STE5 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMARCD3Q6STE5 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMARCD3Q6STE5 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMARCD3Q6STE5 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMARCD3Q6STE5 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMARCD3Q6STE5 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMARCD3Q6STE5 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMARCD3Q6STE5 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMARCD3Q6STE5 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SMARCD3Q6STE5 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SMARCD3Q6STE5 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMARCD3Q6STE5 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SMARCD3Q6STE5 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMARCD3Q6STE5 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMARCD3Q6STE5 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMARCD3Q6STE5 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMARCD3Q6STE5 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMARCD3Q6STE5 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMARCD3Q6STE5 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMARCD3Q6STE5 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMARCD3Q6STE5 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMARCD3Q6STE5 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMARCD3Q6STE5 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMARCD3Q6STE5 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMARCD3Q6STE5 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMARCD3Q6STE5 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMARCD3Q6STE5 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMARCD3Q6STE5 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMARCD3Q6STE5 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMARCD3Q6STE5 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMARCD3Q6STE5 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMARCD3Q6STE5 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMARCD3Q6STE5 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMARCD3Q6STE5 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMARCD3Q6STE5 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMARCD3Q6STE5 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMARCD3Q6STE5 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMARCD3Q6STE5 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMARCD3Q6STE5 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMARCD3Q6STE5 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMARCD3Q6STE5 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMARCD3Q6STE5 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMARCD3Q6STE5 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMARCD3Q6STE5 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMARCD3Q6STE5 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMARCD3Q6STE5 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMARCD3Q6STE5 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMARCD3Q6STE5 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SMARCD3Q6STE5 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMARCD3Q6STE5 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMARCD3Q6STE5 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SMARCD3Q6STE5 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMARCD3Q6STE5 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SMARCD3Q6STE5 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMARCD3Q6STE5 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMARCD3Q6STE5 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMARCD3Q6STE5 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMARCD3Q6STE5 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMARCD3Q6STE5 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMARCD3Q6STE5 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMARCD3Q6STE5 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMARCD3Q6STE5 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMARCD3Q6STE5 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMARCD3Q6STE5 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMARCD3Q6STE5 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMARCD3Q6STE5 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMARCD3Q6STE5 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SMARCD3Q6STE5 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMARCD3Q6STE5 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMARCD3Q6STE5 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMARCD3Q6STE5 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms