Protein–RNA interactions for Protein: Q6AI12

ANKRD40, Ankyrin repeat domain-containing protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD40Q6AI12 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ANKRD40Q6AI12 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ANKRD40Q6AI12 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ANKRD40Q6AI12 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ANKRD40Q6AI12 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ANKRD40Q6AI12 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ANKRD40Q6AI12 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ANKRD40Q6AI12 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ANKRD40Q6AI12 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ANKRD40Q6AI12 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ANKRD40Q6AI12 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ANKRD40Q6AI12 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ANKRD40Q6AI12 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ANKRD40Q6AI12 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ANKRD40Q6AI12 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ANKRD40Q6AI12 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ANKRD40Q6AI12 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ANKRD40Q6AI12 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
ANKRD40Q6AI12 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ANKRD40Q6AI12 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ANKRD40Q6AI12 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ANKRD40Q6AI12 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
ANKRD40Q6AI12 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ANKRD40Q6AI12 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ANKRD40Q6AI12 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ANKRD40Q6AI12 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
ANKRD40Q6AI12 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ANKRD40Q6AI12 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ANKRD40Q6AI12 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ANKRD40Q6AI12 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ANKRD40Q6AI12 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ANKRD40Q6AI12 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ANKRD40Q6AI12 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ANKRD40Q6AI12 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ANKRD40Q6AI12 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ANKRD40Q6AI12 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ANKRD40Q6AI12 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ANKRD40Q6AI12 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ANKRD40Q6AI12 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ANKRD40Q6AI12 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ANKRD40Q6AI12 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ANKRD40Q6AI12 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ANKRD40Q6AI12 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ANKRD40Q6AI12 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ANKRD40Q6AI12 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ANKRD40Q6AI12 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ANKRD40Q6AI12 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ANKRD40Q6AI12 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ANKRD40Q6AI12 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ANKRD40Q6AI12 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ANKRD40Q6AI12 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ANKRD40Q6AI12 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ANKRD40Q6AI12 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ANKRD40Q6AI12 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ANKRD40Q6AI12 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ANKRD40Q6AI12 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ANKRD40Q6AI12 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ANKRD40Q6AI12 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ANKRD40Q6AI12 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
ANKRD40Q6AI12 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
ANKRD40Q6AI12 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
ANKRD40Q6AI12 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ANKRD40Q6AI12 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ANKRD40Q6AI12 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ANKRD40Q6AI12 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ANKRD40Q6AI12 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ANKRD40Q6AI12 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ANKRD40Q6AI12 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ANKRD40Q6AI12 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ANKRD40Q6AI12 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ANKRD40Q6AI12 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ANKRD40Q6AI12 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ANKRD40Q6AI12 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ANKRD40Q6AI12 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ANKRD40Q6AI12 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ANKRD40Q6AI12 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ANKRD40Q6AI12 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ANKRD40Q6AI12 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ANKRD40Q6AI12 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ANKRD40Q6AI12 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
ANKRD40Q6AI12 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ANKRD40Q6AI12 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ANKRD40Q6AI12 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ANKRD40Q6AI12 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ANKRD40Q6AI12 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ANKRD40Q6AI12 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ANKRD40Q6AI12 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ANKRD40Q6AI12 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ANKRD40Q6AI12 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ANKRD40Q6AI12 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ANKRD40Q6AI12 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ANKRD40Q6AI12 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ANKRD40Q6AI12 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ANKRD40Q6AI12 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ANKRD40Q6AI12 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ANKRD40Q6AI12 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ANKRD40Q6AI12 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ANKRD40Q6AI12 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ANKRD40Q6AI12 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ANKRD40Q6AI12 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.9 ms