Protein–RNA interactions for Protein: Q3B726

TWISTNB, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA43, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWISTNBQ3B726 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TWISTNBQ3B726 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TWISTNBQ3B726 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TWISTNBQ3B726 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TWISTNBQ3B726 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TWISTNBQ3B726 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TWISTNBQ3B726 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TWISTNBQ3B726 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TWISTNBQ3B726 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TWISTNBQ3B726 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TWISTNBQ3B726 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TWISTNBQ3B726 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TWISTNBQ3B726 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TWISTNBQ3B726 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
TWISTNBQ3B726 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TWISTNBQ3B726 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TWISTNBQ3B726 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TWISTNBQ3B726 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
TWISTNBQ3B726 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TWISTNBQ3B726 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TWISTNBQ3B726 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TWISTNBQ3B726 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
TWISTNBQ3B726 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TWISTNBQ3B726 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TWISTNBQ3B726 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TWISTNBQ3B726 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TWISTNBQ3B726 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TWISTNBQ3B726 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TWISTNBQ3B726 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TWISTNBQ3B726 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TWISTNBQ3B726 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TWISTNBQ3B726 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TWISTNBQ3B726 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TWISTNBQ3B726 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TWISTNBQ3B726 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TWISTNBQ3B726 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TWISTNBQ3B726 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TWISTNBQ3B726 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TWISTNBQ3B726 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TWISTNBQ3B726 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TWISTNBQ3B726 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TWISTNBQ3B726 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TWISTNBQ3B726 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
TWISTNBQ3B726 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TWISTNBQ3B726 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TWISTNBQ3B726 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TWISTNBQ3B726 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TWISTNBQ3B726 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TWISTNBQ3B726 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TWISTNBQ3B726 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
TWISTNBQ3B726 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TWISTNBQ3B726 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TWISTNBQ3B726 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TWISTNBQ3B726 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TWISTNBQ3B726 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TWISTNBQ3B726 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TWISTNBQ3B726 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TWISTNBQ3B726 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TWISTNBQ3B726 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
TWISTNBQ3B726 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TWISTNBQ3B726 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TWISTNBQ3B726 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TWISTNBQ3B726 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TWISTNBQ3B726 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TWISTNBQ3B726 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TWISTNBQ3B726 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TWISTNBQ3B726 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TWISTNBQ3B726 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TWISTNBQ3B726 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TWISTNBQ3B726 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TWISTNBQ3B726 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TWISTNBQ3B726 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TWISTNBQ3B726 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TWISTNBQ3B726 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TWISTNBQ3B726 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TWISTNBQ3B726 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TWISTNBQ3B726 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TWISTNBQ3B726 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TWISTNBQ3B726 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TWISTNBQ3B726 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TWISTNBQ3B726 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
TWISTNBQ3B726 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TWISTNBQ3B726 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TWISTNBQ3B726 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TWISTNBQ3B726 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TWISTNBQ3B726 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TWISTNBQ3B726 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TWISTNBQ3B726 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
TWISTNBQ3B726 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
TWISTNBQ3B726 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
TWISTNBQ3B726 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TWISTNBQ3B726 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TWISTNBQ3B726 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TWISTNBQ3B726 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TWISTNBQ3B726 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TWISTNBQ3B726 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TWISTNBQ3B726 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TWISTNBQ3B726 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TWISTNBQ3B726 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TWISTNBQ3B726 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.8 ms