Protein–RNA interactions for Protein: Q1T7F1

Putative chemokine-related protein B42, humanhuman

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Length 81 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q1T7F1 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
Q1T7F1 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
Q1T7F1 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
Q1T7F1 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC8.9□□□□□ -0.98
Q1T7F1 ARGLU1-203ENST00000400198 3390 ntTSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
Q1T7F1 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
Q1T7F1 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
Q1T7F1 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC8.9□□□□□ -0.98
Q1T7F1 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC8.9□□□□□ -0.98
Q1T7F1 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
Q1T7F1 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
Q1T7F1 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC8.9□□□□□ -0.98
Q1T7F1 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
Q1T7F1 MYOM3-202ENST00000374434 5804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
Q1T7F1 ARNTL-202ENST00000401424 2788 ntTSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
Q1T7F1 CSNK1D-202ENST00000314028 3712 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
Q1T7F1 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
Q1T7F1 RBM10-202ENST00000345781 3108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.9□□□□□ -0.98
Q1T7F1 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
Q1T7F1 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
Q1T7F1 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
Q1T7F1 CELF4-201ENST00000334919 3542 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.99
Q1T7F1 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.99
Q1T7F1 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.99
Q1T7F1 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.99
Q1T7F1 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.9□□□□□ -0.99
Q1T7F1 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.99
Q1T7F1 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC8.9□□□□□ -0.99
Q1T7F1 SETD1A-201ENST00000262519 6451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.99
Q1T7F1 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC8.9□□□□□ -0.99
Q1T7F1 SMARCA5-201ENST00000283131 7923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.99
Q1T7F1 PRPF8-205ENST00000572621 7445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
Q1T7F1 PAM-201ENST00000304400 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Q1T7F1 COL8A2-201ENST00000303143 4447 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.89□□□□□ -0.99
Q1T7F1 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Q1T7F1 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.89□□□□□ -0.99
Q1T7F1 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Q1T7F1 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC8.89□□□□□ -0.99
Q1T7F1 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC8.89□□□□□ -0.99
Q1T7F1 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC8.89□□□□□ -0.99
Q1T7F1 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Q1T7F1 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.89□□□□□ -0.99
Q1T7F1 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
Q1T7F1 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC8.89□□□□□ -0.99
Q1T7F1 NLGN3-206ENST00000612180 3319 ntTSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
Q1T7F1 FAM168B-202ENST00000409185 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Q1T7F1 ABCG2-201ENST00000237612 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Q1T7F1 COPS7B-201ENST00000350033 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Q1T7F1 SNHG28-201ENST00000368102 2501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.89□□□□□ -0.99
Q1T7F1 LSS-211ENST00000522411 2523 ntTSL 2 BASIC8.89□□□□□ -0.99
Q1T7F1 SDC1-202ENST00000381150 3291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
Q1T7F1 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Q1T7F1 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Q1T7F1 AFDN-211ENST00000447894 5475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
Q1T7F1 CEP135-202ENST00000422247 2092 ntTSL 2 BASIC8.89□□□□□ -0.99
Q1T7F1 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
Q1T7F1 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
Q1T7F1 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Q1T7F1 VTI1B-204ENST00000554659 5351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Q1T7F1 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
Q1T7F1 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
Q1T7F1 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
Q1T7F1 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
Q1T7F1 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
Q1T7F1 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
Q1T7F1 C9orf152-201ENST00000400613 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Q1T7F1 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Q1T7F1 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
Q1T7F1 CYB561D1-206ENST00000496961 3424 ntTSL 2 BASIC8.89□□□□□ -0.99
Q1T7F1 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Q1T7F1 CBFA2T3-201ENST00000268679 4477 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Q1T7F1 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.89□□□□□ -0.99
Q1T7F1 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Q1T7F1 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Q1T7F1 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Q1T7F1 GGT1-203ENST00000400382 2628 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.89□□□□□ -0.99
Q1T7F1 ABCA7-202ENST00000433129 6704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Q1T7F1 AC019294.4-201ENST00000561777 2905 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
Q1T7F1 FAM212B-201ENST00000357260 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Q1T7F1 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Q1T7F1 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
Q1T7F1 UBE3A-209ENST00000625778 3217 ntTSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
Q1T7F1 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC8.89□□□□□ -0.99
Q1T7F1 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Q1T7F1 SORCS1-201ENST00000263054 7272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Q1T7F1 MED12L-202ENST00000309237 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.89□□□□□ -0.99
Q1T7F1 ATXN2L-215ENST00000564304 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Q1T7F1 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC8.89□□□□□ -0.99
Q1T7F1 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Q1T7F1 RAP2B-201ENST00000323534 8351 ntAPPRIS P1 BASIC8.89□□□□□ -0.99
Q1T7F1 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
Q1T7F1 KIAA1161-201ENST00000297625 6398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Q1T7F1 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Q1T7F1 MAPKBP1-215ENST00000514566 5394 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Q1T7F1 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
Q1T7F1 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC8.89□□□□□ -0.99
Q1T7F1 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
Q1T7F1 KCNIP2-203ENST00000348850 2089 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Q1T7F1 AC011474.4-201ENST00000623523 2076 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
Q1T7F1 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
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