Protein–RNA interactions for Protein: Q16654

PDK4, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 4, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK4Q16654 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PDK4Q16654 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PDK4Q16654 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PDK4Q16654 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PDK4Q16654 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PDK4Q16654 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PDK4Q16654 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PDK4Q16654 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PDK4Q16654 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PDK4Q16654 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PDK4Q16654 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PDK4Q16654 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PDK4Q16654 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PDK4Q16654 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PDK4Q16654 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PDK4Q16654 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PDK4Q16654 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PDK4Q16654 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PDK4Q16654 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PDK4Q16654 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PDK4Q16654 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PDK4Q16654 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PDK4Q16654 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PDK4Q16654 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PDK4Q16654 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PDK4Q16654 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PDK4Q16654 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PDK4Q16654 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PDK4Q16654 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PDK4Q16654 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PDK4Q16654 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PDK4Q16654 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PDK4Q16654 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PDK4Q16654 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PDK4Q16654 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PDK4Q16654 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PDK4Q16654 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
PDK4Q16654 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PDK4Q16654 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PDK4Q16654 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PDK4Q16654 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PDK4Q16654 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PDK4Q16654 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PDK4Q16654 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PDK4Q16654 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PDK4Q16654 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PDK4Q16654 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PDK4Q16654 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PDK4Q16654 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PDK4Q16654 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PDK4Q16654 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PDK4Q16654 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PDK4Q16654 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PDK4Q16654 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PDK4Q16654 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PDK4Q16654 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PDK4Q16654 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PDK4Q16654 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PDK4Q16654 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PDK4Q16654 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PDK4Q16654 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PDK4Q16654 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PDK4Q16654 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PDK4Q16654 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PDK4Q16654 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PDK4Q16654 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PDK4Q16654 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PDK4Q16654 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PDK4Q16654 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PDK4Q16654 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PDK4Q16654 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PDK4Q16654 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PDK4Q16654 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PDK4Q16654 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PDK4Q16654 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PDK4Q16654 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PDK4Q16654 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PDK4Q16654 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PDK4Q16654 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PDK4Q16654 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PDK4Q16654 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PDK4Q16654 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PDK4Q16654 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PDK4Q16654 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PDK4Q16654 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PDK4Q16654 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PDK4Q16654 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PDK4Q16654 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PDK4Q16654 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PDK4Q16654 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PDK4Q16654 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PDK4Q16654 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PDK4Q16654 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PDK4Q16654 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PDK4Q16654 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PDK4Q16654 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PDK4Q16654 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PDK4Q16654 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PDK4Q16654 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PDK4Q16654 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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