Protein–RNA interactions for Protein: Q16445

GABRA6, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA6Q16445 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GABRA6Q16445 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GABRA6Q16445 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GABRA6Q16445 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GABRA6Q16445 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GABRA6Q16445 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GABRA6Q16445 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GABRA6Q16445 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GABRA6Q16445 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GABRA6Q16445 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GABRA6Q16445 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GABRA6Q16445 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GABRA6Q16445 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GABRA6Q16445 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GABRA6Q16445 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GABRA6Q16445 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GABRA6Q16445 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GABRA6Q16445 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GABRA6Q16445 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GABRA6Q16445 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GABRA6Q16445 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GABRA6Q16445 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GABRA6Q16445 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GABRA6Q16445 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GABRA6Q16445 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GABRA6Q16445 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GABRA6Q16445 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GABRA6Q16445 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GABRA6Q16445 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GABRA6Q16445 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GABRA6Q16445 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
GABRA6Q16445 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GABRA6Q16445 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
GABRA6Q16445 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GABRA6Q16445 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GABRA6Q16445 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GABRA6Q16445 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GABRA6Q16445 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GABRA6Q16445 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GABRA6Q16445 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GABRA6Q16445 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
GABRA6Q16445 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
GABRA6Q16445 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
GABRA6Q16445 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
GABRA6Q16445 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
GABRA6Q16445 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
GABRA6Q16445 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
GABRA6Q16445 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
GABRA6Q16445 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
GABRA6Q16445 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
GABRA6Q16445 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
GABRA6Q16445 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
GABRA6Q16445 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
GABRA6Q16445 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
GABRA6Q16445 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
GABRA6Q16445 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
GABRA6Q16445 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
GABRA6Q16445 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
GABRA6Q16445 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
GABRA6Q16445 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
GABRA6Q16445 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
GABRA6Q16445 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
GABRA6Q16445 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
GABRA6Q16445 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
GABRA6Q16445 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
GABRA6Q16445 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
GABRA6Q16445 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
GABRA6Q16445 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
GABRA6Q16445 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
GABRA6Q16445 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
GABRA6Q16445 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
GABRA6Q16445 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
GABRA6Q16445 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
GABRA6Q16445 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
GABRA6Q16445 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
GABRA6Q16445 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
GABRA6Q16445 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
GABRA6Q16445 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
GABRA6Q16445 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
GABRA6Q16445 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
GABRA6Q16445 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
GABRA6Q16445 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
GABRA6Q16445 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
GABRA6Q16445 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
GABRA6Q16445 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
GABRA6Q16445 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
GABRA6Q16445 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
GABRA6Q16445 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
GABRA6Q16445 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
GABRA6Q16445 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
GABRA6Q16445 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
GABRA6Q16445 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
GABRA6Q16445 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
GABRA6Q16445 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
GABRA6Q16445 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
GABRA6Q16445 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
GABRA6Q16445 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
GABRA6Q16445 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
GABRA6Q16445 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
GABRA6Q16445 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.7 ms