Protein–RNA interactions for Protein: Q15699

ALX1, ALX homeobox protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALX1Q15699 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
ALX1Q15699 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
ALX1Q15699 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
ALX1Q15699 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
ALX1Q15699 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
ALX1Q15699 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ALX1Q15699 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ALX1Q15699 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
ALX1Q15699 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ALX1Q15699 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ALX1Q15699 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ALX1Q15699 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
ALX1Q15699 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ALX1Q15699 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ALX1Q15699 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ALX1Q15699 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ALX1Q15699 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ALX1Q15699 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
ALX1Q15699 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ALX1Q15699 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
ALX1Q15699 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
ALX1Q15699 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
ALX1Q15699 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
ALX1Q15699 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ALX1Q15699 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
ALX1Q15699 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
ALX1Q15699 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
ALX1Q15699 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
ALX1Q15699 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC19.69■□□□□ 0.74
ALX1Q15699 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
ALX1Q15699 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
ALX1Q15699 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
ALX1Q15699 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
ALX1Q15699 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
ALX1Q15699 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
ALX1Q15699 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ALX1Q15699 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
ALX1Q15699 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
ALX1Q15699 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
ALX1Q15699 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ALX1Q15699 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
ALX1Q15699 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
ALX1Q15699 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ALX1Q15699 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ALX1Q15699 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ALX1Q15699 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ALX1Q15699 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
ALX1Q15699 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ALX1Q15699 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ALX1Q15699 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ALX1Q15699 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ALX1Q15699 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ALX1Q15699 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
ALX1Q15699 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ALX1Q15699 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
ALX1Q15699 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
ALX1Q15699 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ALX1Q15699 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
ALX1Q15699 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
ALX1Q15699 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
ALX1Q15699 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
ALX1Q15699 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ALX1Q15699 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ALX1Q15699 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
ALX1Q15699 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
ALX1Q15699 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
ALX1Q15699 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
ALX1Q15699 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
ALX1Q15699 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
ALX1Q15699 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
ALX1Q15699 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
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ALX1Q15699 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
ALX1Q15699 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ALX1Q15699 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ALX1Q15699 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
ALX1Q15699 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ALX1Q15699 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
ALX1Q15699 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ALX1Q15699 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
ALX1Q15699 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ALX1Q15699 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ALX1Q15699 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
ALX1Q15699 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ALX1Q15699 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
ALX1Q15699 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
ALX1Q15699 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ALX1Q15699 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ALX1Q15699 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ALX1Q15699 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ALX1Q15699 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ALX1Q15699 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ALX1Q15699 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ALX1Q15699 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ALX1Q15699 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ALX1Q15699 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ALX1Q15699 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ALX1Q15699 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ALX1Q15699 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ALX1Q15699 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
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