Protein–RNA interactions for Protein: Q15477

SKIV2L, Helicase SKI2W, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIV2LQ15477 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SKIV2LQ15477 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SKIV2LQ15477 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SKIV2LQ15477 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SKIV2LQ15477 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SKIV2LQ15477 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SKIV2LQ15477 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SKIV2LQ15477 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SKIV2LQ15477 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SKIV2LQ15477 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SKIV2LQ15477 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
SKIV2LQ15477 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SKIV2LQ15477 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SKIV2LQ15477 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
SKIV2LQ15477 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SKIV2LQ15477 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SKIV2LQ15477 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
SKIV2LQ15477 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SKIV2LQ15477 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SKIV2LQ15477 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SKIV2LQ15477 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SKIV2LQ15477 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SKIV2LQ15477 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SKIV2LQ15477 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SKIV2LQ15477 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SKIV2LQ15477 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SKIV2LQ15477 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
SKIV2LQ15477 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SKIV2LQ15477 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SKIV2LQ15477 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SKIV2LQ15477 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SKIV2LQ15477 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SKIV2LQ15477 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SKIV2LQ15477 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SKIV2LQ15477 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SKIV2LQ15477 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SKIV2LQ15477 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SKIV2LQ15477 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SKIV2LQ15477 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
SKIV2LQ15477 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SKIV2LQ15477 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SKIV2LQ15477 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SKIV2LQ15477 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SKIV2LQ15477 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SKIV2LQ15477 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SKIV2LQ15477 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SKIV2LQ15477 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SKIV2LQ15477 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SKIV2LQ15477 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SKIV2LQ15477 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SKIV2LQ15477 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SKIV2LQ15477 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SKIV2LQ15477 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SKIV2LQ15477 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SKIV2LQ15477 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SKIV2LQ15477 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SKIV2LQ15477 HLA-DPB2-205ENST00000435074 1188 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
SKIV2LQ15477 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SKIV2LQ15477 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SKIV2LQ15477 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SKIV2LQ15477 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SKIV2LQ15477 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SKIV2LQ15477 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SKIV2LQ15477 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
SKIV2LQ15477 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
SKIV2LQ15477 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SKIV2LQ15477 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
SKIV2LQ15477 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
SKIV2LQ15477 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SKIV2LQ15477 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SKIV2LQ15477 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
SKIV2LQ15477 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SKIV2LQ15477 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SKIV2LQ15477 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SKIV2LQ15477 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SKIV2LQ15477 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SKIV2LQ15477 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SKIV2LQ15477 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
SKIV2LQ15477 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SKIV2LQ15477 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SKIV2LQ15477 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SKIV2LQ15477 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SKIV2LQ15477 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SKIV2LQ15477 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SKIV2LQ15477 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SKIV2LQ15477 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SKIV2LQ15477 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SKIV2LQ15477 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SKIV2LQ15477 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SKIV2LQ15477 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SKIV2LQ15477 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SKIV2LQ15477 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SKIV2LQ15477 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SKIV2LQ15477 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SKIV2LQ15477 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SKIV2LQ15477 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SKIV2LQ15477 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
SKIV2LQ15477 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
SKIV2LQ15477 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SKIV2LQ15477 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms