Protein–RNA interactions for Protein: Q14596

NBR1, Next to BRCA1 gene 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 966 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBR1Q14596 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NBR1Q14596 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
NBR1Q14596 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
NBR1Q14596 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NBR1Q14596 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
NBR1Q14596 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NBR1Q14596 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
NBR1Q14596 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
NBR1Q14596 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NBR1Q14596 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
NBR1Q14596 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
NBR1Q14596 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
NBR1Q14596 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
NBR1Q14596 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
NBR1Q14596 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
NBR1Q14596 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NBR1Q14596 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
NBR1Q14596 AL589935.2-201ENST00000616471 1231 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
NBR1Q14596 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
NBR1Q14596 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
NBR1Q14596 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NBR1Q14596 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
NBR1Q14596 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NBR1Q14596 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NBR1Q14596 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NBR1Q14596 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NBR1Q14596 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NBR1Q14596 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
NBR1Q14596 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
NBR1Q14596 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
NBR1Q14596 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
NBR1Q14596 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
NBR1Q14596 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NBR1Q14596 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NBR1Q14596 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
NBR1Q14596 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NBR1Q14596 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NBR1Q14596 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NBR1Q14596 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
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NBR1Q14596 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
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NBR1Q14596 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
NBR1Q14596 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NBR1Q14596 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NBR1Q14596 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
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NBR1Q14596 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC20.79■□□□□ 0.92
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