Protein–RNA interactions for Protein: Q14264

ERV3-1, Endogenous retrovirus group 3 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERV3-1Q14264 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ERV3-1Q14264 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ERV3-1Q14264 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ERV3-1Q14264 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ERV3-1Q14264 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ERV3-1Q14264 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ERV3-1Q14264 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ERV3-1Q14264 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ERV3-1Q14264 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ERV3-1Q14264 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ERV3-1Q14264 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ERV3-1Q14264 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ERV3-1Q14264 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ERV3-1Q14264 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ERV3-1Q14264 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ERV3-1Q14264 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ERV3-1Q14264 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ERV3-1Q14264 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERV3-1Q14264 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERV3-1Q14264 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERV3-1Q14264 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERV3-1Q14264 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERV3-1Q14264 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERV3-1Q14264 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERV3-1Q14264 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERV3-1Q14264 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERV3-1Q14264 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERV3-1Q14264 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERV3-1Q14264 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERV3-1Q14264 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERV3-1Q14264 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERV3-1Q14264 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERV3-1Q14264 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERV3-1Q14264 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERV3-1Q14264 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ERV3-1Q14264 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ERV3-1Q14264 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ERV3-1Q14264 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ERV3-1Q14264 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERV3-1Q14264 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ERV3-1Q14264 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERV3-1Q14264 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ERV3-1Q14264 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERV3-1Q14264 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERV3-1Q14264 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERV3-1Q14264 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERV3-1Q14264 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ERV3-1Q14264 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ERV3-1Q14264 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERV3-1Q14264 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERV3-1Q14264 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERV3-1Q14264 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERV3-1Q14264 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERV3-1Q14264 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERV3-1Q14264 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERV3-1Q14264 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERV3-1Q14264 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERV3-1Q14264 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERV3-1Q14264 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERV3-1Q14264 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERV3-1Q14264 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERV3-1Q14264 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERV3-1Q14264 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERV3-1Q14264 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERV3-1Q14264 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ERV3-1Q14264 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ERV3-1Q14264 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ERV3-1Q14264 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ERV3-1Q14264 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ERV3-1Q14264 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ERV3-1Q14264 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ERV3-1Q14264 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ERV3-1Q14264 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ERV3-1Q14264 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ERV3-1Q14264 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ERV3-1Q14264 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ERV3-1Q14264 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ERV3-1Q14264 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ERV3-1Q14264 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ERV3-1Q14264 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ERV3-1Q14264 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ERV3-1Q14264 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ERV3-1Q14264 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ERV3-1Q14264 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ERV3-1Q14264 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ERV3-1Q14264 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ERV3-1Q14264 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ERV3-1Q14264 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ERV3-1Q14264 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ERV3-1Q14264 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ERV3-1Q14264 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ERV3-1Q14264 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ERV3-1Q14264 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ERV3-1Q14264 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ERV3-1Q14264 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ERV3-1Q14264 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ERV3-1Q14264 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ERV3-1Q14264 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ERV3-1Q14264 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ERV3-1Q14264 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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