Protein–RNA interactions for Protein: Q14028

CNGB1, Cyclic nucleotide-gated cation channel beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,251 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGB1Q14028 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CNGB1Q14028 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CNGB1Q14028 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CNGB1Q14028 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CNGB1Q14028 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CNGB1Q14028 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CNGB1Q14028 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CNGB1Q14028 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CNGB1Q14028 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CNGB1Q14028 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CNGB1Q14028 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CNGB1Q14028 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CNGB1Q14028 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CNGB1Q14028 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CNGB1Q14028 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CNGB1Q14028 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CNGB1Q14028 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CNGB1Q14028 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CNGB1Q14028 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CNGB1Q14028 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CNGB1Q14028 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CNGB1Q14028 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CNGB1Q14028 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CNGB1Q14028 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CNGB1Q14028 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CNGB1Q14028 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CNGB1Q14028 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CNGB1Q14028 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CNGB1Q14028 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CNGB1Q14028 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CNGB1Q14028 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CNGB1Q14028 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CNGB1Q14028 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CNGB1Q14028 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CNGB1Q14028 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CNGB1Q14028 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CNGB1Q14028 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CNGB1Q14028 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CNGB1Q14028 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CNGB1Q14028 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CNGB1Q14028 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CNGB1Q14028 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CNGB1Q14028 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CNGB1Q14028 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CNGB1Q14028 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CNGB1Q14028 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CNGB1Q14028 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CNGB1Q14028 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CNGB1Q14028 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CNGB1Q14028 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CNGB1Q14028 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CNGB1Q14028 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CNGB1Q14028 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CNGB1Q14028 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CNGB1Q14028 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CNGB1Q14028 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CNGB1Q14028 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CNGB1Q14028 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CNGB1Q14028 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CNGB1Q14028 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CNGB1Q14028 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CNGB1Q14028 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CNGB1Q14028 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CNGB1Q14028 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CNGB1Q14028 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CNGB1Q14028 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CNGB1Q14028 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CNGB1Q14028 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CNGB1Q14028 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CNGB1Q14028 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CNGB1Q14028 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CNGB1Q14028 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CNGB1Q14028 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CNGB1Q14028 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CNGB1Q14028 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CNGB1Q14028 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CNGB1Q14028 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CNGB1Q14028 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CNGB1Q14028 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CNGB1Q14028 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CNGB1Q14028 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CNGB1Q14028 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CNGB1Q14028 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CNGB1Q14028 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CNGB1Q14028 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CNGB1Q14028 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CNGB1Q14028 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CNGB1Q14028 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CNGB1Q14028 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CNGB1Q14028 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CNGB1Q14028 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CNGB1Q14028 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CNGB1Q14028 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CNGB1Q14028 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CNGB1Q14028 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CNGB1Q14028 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CNGB1Q14028 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CNGB1Q14028 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CNGB1Q14028 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CNGB1Q14028 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
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