Protein–RNA interactions for Protein: Q13753

LAMC2, Laminin subunit gamma-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMC2Q13753 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LAMC2Q13753 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LAMC2Q13753 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LAMC2Q13753 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LAMC2Q13753 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LAMC2Q13753 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
LAMC2Q13753 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LAMC2Q13753 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LAMC2Q13753 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LAMC2Q13753 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LAMC2Q13753 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LAMC2Q13753 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LAMC2Q13753 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LAMC2Q13753 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LAMC2Q13753 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LAMC2Q13753 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LAMC2Q13753 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LAMC2Q13753 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LAMC2Q13753 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LAMC2Q13753 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LAMC2Q13753 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LAMC2Q13753 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LAMC2Q13753 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LAMC2Q13753 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LAMC2Q13753 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LAMC2Q13753 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LAMC2Q13753 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LAMC2Q13753 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LAMC2Q13753 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LAMC2Q13753 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LAMC2Q13753 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LAMC2Q13753 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LAMC2Q13753 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LAMC2Q13753 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LAMC2Q13753 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LAMC2Q13753 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LAMC2Q13753 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LAMC2Q13753 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LAMC2Q13753 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LAMC2Q13753 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LAMC2Q13753 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LAMC2Q13753 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LAMC2Q13753 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
LAMC2Q13753 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LAMC2Q13753 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LAMC2Q13753 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LAMC2Q13753 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LAMC2Q13753 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LAMC2Q13753 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LAMC2Q13753 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LAMC2Q13753 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LAMC2Q13753 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
LAMC2Q13753 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LAMC2Q13753 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LAMC2Q13753 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LAMC2Q13753 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
LAMC2Q13753 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LAMC2Q13753 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LAMC2Q13753 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LAMC2Q13753 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LAMC2Q13753 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LAMC2Q13753 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LAMC2Q13753 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LAMC2Q13753 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LAMC2Q13753 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LAMC2Q13753 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LAMC2Q13753 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LAMC2Q13753 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
LAMC2Q13753 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
LAMC2Q13753 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LAMC2Q13753 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LAMC2Q13753 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LAMC2Q13753 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LAMC2Q13753 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LAMC2Q13753 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
LAMC2Q13753 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LAMC2Q13753 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
LAMC2Q13753 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
LAMC2Q13753 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LAMC2Q13753 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LAMC2Q13753 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LAMC2Q13753 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LAMC2Q13753 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LAMC2Q13753 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LAMC2Q13753 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LAMC2Q13753 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LAMC2Q13753 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LAMC2Q13753 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LAMC2Q13753 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LAMC2Q13753 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LAMC2Q13753 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LAMC2Q13753 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LAMC2Q13753 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LAMC2Q13753 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LAMC2Q13753 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
LAMC2Q13753 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LAMC2Q13753 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
LAMC2Q13753 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LAMC2Q13753 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LAMC2Q13753 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
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