Protein–RNA interactions for Protein: Q13131

PRKAA1, 5'-AMP-activated protein kinase catalytic subunit alpha-1, humanhuman

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAA1Q13131 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PRKAA1Q13131 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PRKAA1Q13131 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PRKAA1Q13131 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PRKAA1Q13131 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PRKAA1Q13131 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PRKAA1Q13131 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PRKAA1Q13131 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PRKAA1Q13131 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PRKAA1Q13131 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PRKAA1Q13131 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PRKAA1Q13131 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PRKAA1Q13131 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PRKAA1Q13131 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PRKAA1Q13131 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PRKAA1Q13131 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PRKAA1Q13131 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PRKAA1Q13131 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PRKAA1Q13131 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PRKAA1Q13131 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PRKAA1Q13131 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PRKAA1Q13131 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PRKAA1Q13131 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PRKAA1Q13131 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PRKAA1Q13131 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
PRKAA1Q13131 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PRKAA1Q13131 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
PRKAA1Q13131 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PRKAA1Q13131 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PRKAA1Q13131 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PRKAA1Q13131 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PRKAA1Q13131 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PRKAA1Q13131 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PRKAA1Q13131 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PRKAA1Q13131 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PRKAA1Q13131 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PRKAA1Q13131 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
PRKAA1Q13131 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PRKAA1Q13131 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PRKAA1Q13131 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PRKAA1Q13131 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PRKAA1Q13131 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PRKAA1Q13131 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PRKAA1Q13131 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PRKAA1Q13131 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PRKAA1Q13131 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PRKAA1Q13131 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PRKAA1Q13131 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PRKAA1Q13131 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PRKAA1Q13131 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PRKAA1Q13131 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PRKAA1Q13131 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
PRKAA1Q13131 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PRKAA1Q13131 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PRKAA1Q13131 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
PRKAA1Q13131 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PRKAA1Q13131 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PRKAA1Q13131 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PRKAA1Q13131 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PRKAA1Q13131 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PRKAA1Q13131 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PRKAA1Q13131 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PRKAA1Q13131 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PRKAA1Q13131 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PRKAA1Q13131 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PRKAA1Q13131 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PRKAA1Q13131 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PRKAA1Q13131 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PRKAA1Q13131 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PRKAA1Q13131 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PRKAA1Q13131 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PRKAA1Q13131 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PRKAA1Q13131 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PRKAA1Q13131 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PRKAA1Q13131 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PRKAA1Q13131 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PRKAA1Q13131 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PRKAA1Q13131 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
PRKAA1Q13131 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PRKAA1Q13131 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
PRKAA1Q13131 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PRKAA1Q13131 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PRKAA1Q13131 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PRKAA1Q13131 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PRKAA1Q13131 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PRKAA1Q13131 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PRKAA1Q13131 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PRKAA1Q13131 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PRKAA1Q13131 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PRKAA1Q13131 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PRKAA1Q13131 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PRKAA1Q13131 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PRKAA1Q13131 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PRKAA1Q13131 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PRKAA1Q13131 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PRKAA1Q13131 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PRKAA1Q13131 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
PRKAA1Q13131 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PRKAA1Q13131 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PRKAA1Q13131 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
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