Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
MKRN3Q13064 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
MKRN3Q13064 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
MKRN3Q13064 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
MKRN3Q13064 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
MKRN3Q13064 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
MKRN3Q13064 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
MKRN3Q13064 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
MKRN3Q13064 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
MKRN3Q13064 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
MKRN3Q13064 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
MKRN3Q13064 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
MKRN3Q13064 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
MKRN3Q13064 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
MKRN3Q13064 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
MKRN3Q13064 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
MKRN3Q13064 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
MKRN3Q13064 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
MKRN3Q13064 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
MKRN3Q13064 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC19.44■□□□□ 0.7
MKRN3Q13064 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
MKRN3Q13064 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
MKRN3Q13064 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
MKRN3Q13064 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
MKRN3Q13064 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC19.44■□□□□ 0.7
MKRN3Q13064 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
MKRN3Q13064 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
MKRN3Q13064 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
MKRN3Q13064 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
MKRN3Q13064 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
MKRN3Q13064 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
MKRN3Q13064 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
MKRN3Q13064 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
MKRN3Q13064 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
MKRN3Q13064 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
MKRN3Q13064 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
MKRN3Q13064 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC19.44■□□□□ 0.7
MKRN3Q13064 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
MKRN3Q13064 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
MKRN3Q13064 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
MKRN3Q13064 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
MKRN3Q13064 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
MKRN3Q13064 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
MKRN3Q13064 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
MKRN3Q13064 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
MKRN3Q13064 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
MKRN3Q13064 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
MKRN3Q13064 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
MKRN3Q13064 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
MKRN3Q13064 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
MKRN3Q13064 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
MKRN3Q13064 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
MKRN3Q13064 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
MKRN3Q13064 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.44■□□□□ 0.7
MKRN3Q13064 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
MKRN3Q13064 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
MKRN3Q13064 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
MKRN3Q13064 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
MKRN3Q13064 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
MKRN3Q13064 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
MKRN3Q13064 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
MKRN3Q13064 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
MKRN3Q13064 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
MKRN3Q13064 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
MKRN3Q13064 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
MKRN3Q13064 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
MKRN3Q13064 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
MKRN3Q13064 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
MKRN3Q13064 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
MKRN3Q13064 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
MKRN3Q13064 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
MKRN3Q13064 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
MKRN3Q13064 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
MKRN3Q13064 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
MKRN3Q13064 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
MKRN3Q13064 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
MKRN3Q13064 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
MKRN3Q13064 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
MKRN3Q13064 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
MKRN3Q13064 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
MKRN3Q13064 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
MKRN3Q13064 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
MKRN3Q13064 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
MKRN3Q13064 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
MKRN3Q13064 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
MKRN3Q13064 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
MKRN3Q13064 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
MKRN3Q13064 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
MKRN3Q13064 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
MKRN3Q13064 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
MKRN3Q13064 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
MKRN3Q13064 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
MKRN3Q13064 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
MKRN3Q13064 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
MKRN3Q13064 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
MKRN3Q13064 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
MKRN3Q13064 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
MKRN3Q13064 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
MKRN3Q13064 TMEM108-AS1-201ENST00000504993 705 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
MKRN3Q13064 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
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