Protein–RNA interactions for Protein: Q12996

CSTF3, Cleavage stimulation factor subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 717 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTF3Q12996 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSTF3Q12996 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSTF3Q12996 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSTF3Q12996 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSTF3Q12996 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSTF3Q12996 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSTF3Q12996 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSTF3Q12996 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSTF3Q12996 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSTF3Q12996 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSTF3Q12996 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSTF3Q12996 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSTF3Q12996 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CSTF3Q12996 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CSTF3Q12996 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CSTF3Q12996 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CSTF3Q12996 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CSTF3Q12996 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CSTF3Q12996 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CSTF3Q12996 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CSTF3Q12996 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CSTF3Q12996 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CSTF3Q12996 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CSTF3Q12996 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CSTF3Q12996 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CSTF3Q12996 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CSTF3Q12996 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CSTF3Q12996 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CSTF3Q12996 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CSTF3Q12996 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CSTF3Q12996 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CSTF3Q12996 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CSTF3Q12996 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CSTF3Q12996 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CSTF3Q12996 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CSTF3Q12996 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CSTF3Q12996 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CSTF3Q12996 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CSTF3Q12996 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CSTF3Q12996 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CSTF3Q12996 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CSTF3Q12996 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CSTF3Q12996 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CSTF3Q12996 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CSTF3Q12996 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CSTF3Q12996 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CSTF3Q12996 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CSTF3Q12996 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CSTF3Q12996 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CSTF3Q12996 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
CSTF3Q12996 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CSTF3Q12996 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
CSTF3Q12996 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CSTF3Q12996 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CSTF3Q12996 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CSTF3Q12996 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CSTF3Q12996 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CSTF3Q12996 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CSTF3Q12996 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CSTF3Q12996 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CSTF3Q12996 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CSTF3Q12996 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CSTF3Q12996 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CSTF3Q12996 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CSTF3Q12996 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CSTF3Q12996 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CSTF3Q12996 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CSTF3Q12996 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CSTF3Q12996 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CSTF3Q12996 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CSTF3Q12996 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CSTF3Q12996 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CSTF3Q12996 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CSTF3Q12996 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CSTF3Q12996 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CSTF3Q12996 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CSTF3Q12996 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CSTF3Q12996 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CSTF3Q12996 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CSTF3Q12996 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CSTF3Q12996 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CSTF3Q12996 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CSTF3Q12996 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CSTF3Q12996 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CSTF3Q12996 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CSTF3Q12996 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CSTF3Q12996 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CSTF3Q12996 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CSTF3Q12996 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CSTF3Q12996 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CSTF3Q12996 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CSTF3Q12996 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CSTF3Q12996 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CSTF3Q12996 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CSTF3Q12996 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CSTF3Q12996 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CSTF3Q12996 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CSTF3Q12996 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CSTF3Q12996 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CSTF3Q12996 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
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