Protein–RNA interactions for Protein: Q07837

SLC3A1, Neutral and basic amino acid transport protein rBAT, humanhuman

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC3A1Q07837 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC3A1Q07837 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC3A1Q07837 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC3A1Q07837 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC3A1Q07837 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC3A1Q07837 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC3A1Q07837 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC3A1Q07837 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC3A1Q07837 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC3A1Q07837 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC3A1Q07837 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC3A1Q07837 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC3A1Q07837 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC3A1Q07837 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC3A1Q07837 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC3A1Q07837 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC3A1Q07837 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC3A1Q07837 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC3A1Q07837 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC3A1Q07837 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC3A1Q07837 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC3A1Q07837 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC3A1Q07837 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC3A1Q07837 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC3A1Q07837 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC3A1Q07837 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC3A1Q07837 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC3A1Q07837 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC3A1Q07837 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC3A1Q07837 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC3A1Q07837 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC3A1Q07837 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC3A1Q07837 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC3A1Q07837 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC3A1Q07837 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC3A1Q07837 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC3A1Q07837 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC3A1Q07837 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC3A1Q07837 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC3A1Q07837 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC3A1Q07837 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC3A1Q07837 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC3A1Q07837 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC3A1Q07837 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC3A1Q07837 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC3A1Q07837 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC3A1Q07837 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC3A1Q07837 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC3A1Q07837 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC3A1Q07837 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC3A1Q07837 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC3A1Q07837 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC3A1Q07837 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC3A1Q07837 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC3A1Q07837 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC3A1Q07837 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC3A1Q07837 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC3A1Q07837 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC3A1Q07837 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC3A1Q07837 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC3A1Q07837 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC3A1Q07837 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC3A1Q07837 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC3A1Q07837 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC3A1Q07837 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC3A1Q07837 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC3A1Q07837 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC3A1Q07837 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC3A1Q07837 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC3A1Q07837 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC3A1Q07837 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC3A1Q07837 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC3A1Q07837 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLC3A1Q07837 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLC3A1Q07837 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLC3A1Q07837 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLC3A1Q07837 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLC3A1Q07837 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLC3A1Q07837 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLC3A1Q07837 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLC3A1Q07837 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLC3A1Q07837 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLC3A1Q07837 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLC3A1Q07837 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLC3A1Q07837 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLC3A1Q07837 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLC3A1Q07837 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLC3A1Q07837 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLC3A1Q07837 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLC3A1Q07837 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLC3A1Q07837 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLC3A1Q07837 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLC3A1Q07837 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLC3A1Q07837 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLC3A1Q07837 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLC3A1Q07837 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SLC3A1Q07837 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLC3A1Q07837 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SLC3A1Q07837 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLC3A1Q07837 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms