Protein–RNA interactions for Protein: Q05D32

CTDSPL2, CTD small phosphatase-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSPL2Q05D32 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CTDSPL2Q05D32 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CTDSPL2Q05D32 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CTDSPL2Q05D32 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CTDSPL2Q05D32 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CTDSPL2Q05D32 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CTDSPL2Q05D32 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CTDSPL2Q05D32 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CTDSPL2Q05D32 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
CTDSPL2Q05D32 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.75
CTDSPL2Q05D32 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
CTDSPL2Q05D32 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CTDSPL2Q05D32 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CTDSPL2Q05D32 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CTDSPL2Q05D32 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CTDSPL2Q05D32 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CTDSPL2Q05D32 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CTDSPL2Q05D32 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CTDSPL2Q05D32 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
CTDSPL2Q05D32 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
CTDSPL2Q05D32 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CTDSPL2Q05D32 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CTDSPL2Q05D32 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CTDSPL2Q05D32 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CTDSPL2Q05D32 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CTDSPL2Q05D32 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CTDSPL2Q05D32 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CTDSPL2Q05D32 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CTDSPL2Q05D32 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
CTDSPL2Q05D32 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CTDSPL2Q05D32 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CTDSPL2Q05D32 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CTDSPL2Q05D32 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
CTDSPL2Q05D32 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CTDSPL2Q05D32 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CTDSPL2Q05D32 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CTDSPL2Q05D32 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CTDSPL2Q05D32 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CTDSPL2Q05D32 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CTDSPL2Q05D32 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CTDSPL2Q05D32 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CTDSPL2Q05D32 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CTDSPL2Q05D32 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CTDSPL2Q05D32 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CTDSPL2Q05D32 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CTDSPL2Q05D32 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CTDSPL2Q05D32 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CTDSPL2Q05D32 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CTDSPL2Q05D32 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CTDSPL2Q05D32 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CTDSPL2Q05D32 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CTDSPL2Q05D32 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CTDSPL2Q05D32 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CTDSPL2Q05D32 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CTDSPL2Q05D32 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CTDSPL2Q05D32 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CTDSPL2Q05D32 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CTDSPL2Q05D32 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CTDSPL2Q05D32 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CTDSPL2Q05D32 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CTDSPL2Q05D32 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CTDSPL2Q05D32 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CTDSPL2Q05D32 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CTDSPL2Q05D32 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CTDSPL2Q05D32 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
CTDSPL2Q05D32 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CTDSPL2Q05D32 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CTDSPL2Q05D32 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CTDSPL2Q05D32 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
CTDSPL2Q05D32 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CTDSPL2Q05D32 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
CTDSPL2Q05D32 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CTDSPL2Q05D32 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CTDSPL2Q05D32 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CTDSPL2Q05D32 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CTDSPL2Q05D32 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CTDSPL2Q05D32 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CTDSPL2Q05D32 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CTDSPL2Q05D32 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CTDSPL2Q05D32 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CTDSPL2Q05D32 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CTDSPL2Q05D32 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CTDSPL2Q05D32 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CTDSPL2Q05D32 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CTDSPL2Q05D32 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CTDSPL2Q05D32 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CTDSPL2Q05D32 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CTDSPL2Q05D32 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CTDSPL2Q05D32 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CTDSPL2Q05D32 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CTDSPL2Q05D32 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CTDSPL2Q05D32 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CTDSPL2Q05D32 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CTDSPL2Q05D32 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CTDSPL2Q05D32 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CTDSPL2Q05D32 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CTDSPL2Q05D32 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
CTDSPL2Q05D32 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CTDSPL2Q05D32 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CTDSPL2Q05D32 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms