Protein–RNA interactions for Protein: Q03135

CAV1, Caveolin-1, humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAV1Q03135 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CAV1Q03135 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CAV1Q03135 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CAV1Q03135 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CAV1Q03135 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CAV1Q03135 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CAV1Q03135 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CAV1Q03135 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CAV1Q03135 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CAV1Q03135 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CAV1Q03135 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CAV1Q03135 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CAV1Q03135 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CAV1Q03135 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CAV1Q03135 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CAV1Q03135 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CAV1Q03135 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CAV1Q03135 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CAV1Q03135 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CAV1Q03135 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CAV1Q03135 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CAV1Q03135 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CAV1Q03135 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CAV1Q03135 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CAV1Q03135 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CAV1Q03135 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CAV1Q03135 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CAV1Q03135 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CAV1Q03135 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CAV1Q03135 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CAV1Q03135 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CAV1Q03135 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CAV1Q03135 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CAV1Q03135 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CAV1Q03135 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CAV1Q03135 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CAV1Q03135 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CAV1Q03135 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CAV1Q03135 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CAV1Q03135 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CAV1Q03135 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CAV1Q03135 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CAV1Q03135 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CAV1Q03135 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CAV1Q03135 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CAV1Q03135 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CAV1Q03135 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CAV1Q03135 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CAV1Q03135 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CAV1Q03135 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CAV1Q03135 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CAV1Q03135 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CAV1Q03135 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CAV1Q03135 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CAV1Q03135 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CAV1Q03135 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CAV1Q03135 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CAV1Q03135 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CAV1Q03135 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CAV1Q03135 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CAV1Q03135 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CAV1Q03135 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CAV1Q03135 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CAV1Q03135 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CAV1Q03135 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CAV1Q03135 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CAV1Q03135 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CAV1Q03135 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CAV1Q03135 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CAV1Q03135 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CAV1Q03135 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CAV1Q03135 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CAV1Q03135 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CAV1Q03135 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CAV1Q03135 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CAV1Q03135 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CAV1Q03135 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CAV1Q03135 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CAV1Q03135 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CAV1Q03135 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CAV1Q03135 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CAV1Q03135 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CAV1Q03135 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CAV1Q03135 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CAV1Q03135 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CAV1Q03135 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CAV1Q03135 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CAV1Q03135 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CAV1Q03135 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CAV1Q03135 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CAV1Q03135 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CAV1Q03135 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CAV1Q03135 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CAV1Q03135 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CAV1Q03135 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CAV1Q03135 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CAV1Q03135 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CAV1Q03135 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CAV1Q03135 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CAV1Q03135 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms