Protein–RNA interactions for Protein: Q01892

SPIB, Transcription factor Spi-B, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIBQ01892 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPIBQ01892 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPIBQ01892 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPIBQ01892 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPIBQ01892 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPIBQ01892 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPIBQ01892 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPIBQ01892 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPIBQ01892 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPIBQ01892 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPIBQ01892 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPIBQ01892 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SPIBQ01892 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SPIBQ01892 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPIBQ01892 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPIBQ01892 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPIBQ01892 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPIBQ01892 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPIBQ01892 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPIBQ01892 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPIBQ01892 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPIBQ01892 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPIBQ01892 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPIBQ01892 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPIBQ01892 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPIBQ01892 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPIBQ01892 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPIBQ01892 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPIBQ01892 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPIBQ01892 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPIBQ01892 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPIBQ01892 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPIBQ01892 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPIBQ01892 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPIBQ01892 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPIBQ01892 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPIBQ01892 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPIBQ01892 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPIBQ01892 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPIBQ01892 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPIBQ01892 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPIBQ01892 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPIBQ01892 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SPIBQ01892 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPIBQ01892 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPIBQ01892 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SPIBQ01892 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPIBQ01892 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPIBQ01892 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPIBQ01892 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPIBQ01892 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SPIBQ01892 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPIBQ01892 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPIBQ01892 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPIBQ01892 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPIBQ01892 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SPIBQ01892 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPIBQ01892 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPIBQ01892 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPIBQ01892 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPIBQ01892 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPIBQ01892 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPIBQ01892 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPIBQ01892 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPIBQ01892 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPIBQ01892 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPIBQ01892 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPIBQ01892 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPIBQ01892 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPIBQ01892 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPIBQ01892 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPIBQ01892 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPIBQ01892 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SPIBQ01892 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPIBQ01892 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPIBQ01892 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPIBQ01892 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPIBQ01892 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPIBQ01892 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPIBQ01892 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPIBQ01892 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPIBQ01892 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPIBQ01892 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPIBQ01892 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPIBQ01892 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPIBQ01892 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPIBQ01892 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPIBQ01892 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SPIBQ01892 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPIBQ01892 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPIBQ01892 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPIBQ01892 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPIBQ01892 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPIBQ01892 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPIBQ01892 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPIBQ01892 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SPIBQ01892 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPIBQ01892 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPIBQ01892 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPIBQ01892 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.1 ms