Protein–RNA interactions for Protein: P78414

IRX1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX1P78414 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
IRX1P78414 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
IRX1P78414 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
IRX1P78414 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
IRX1P78414 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
IRX1P78414 AL359183.1-201ENST00000623796 2132 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
IRX1P78414 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
IRX1P78414 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
IRX1P78414 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
IRX1P78414 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
IRX1P78414 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
IRX1P78414 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
IRX1P78414 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
IRX1P78414 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
IRX1P78414 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
IRX1P78414 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
IRX1P78414 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
IRX1P78414 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
IRX1P78414 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
IRX1P78414 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
IRX1P78414 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
IRX1P78414 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
IRX1P78414 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
IRX1P78414 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
IRX1P78414 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
IRX1P78414 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
IRX1P78414 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
IRX1P78414 IFRD1-205ENST00000429071 1938 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
IRX1P78414 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
IRX1P78414 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
IRX1P78414 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
IRX1P78414 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
IRX1P78414 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
IRX1P78414 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
IRX1P78414 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
IRX1P78414 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IRX1P78414 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IRX1P78414 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
IRX1P78414 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
IRX1P78414 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IRX1P78414 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IRX1P78414 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
IRX1P78414 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
IRX1P78414 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IRX1P78414 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IRX1P78414 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IRX1P78414 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IRX1P78414 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IRX1P78414 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
IRX1P78414 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IRX1P78414 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
IRX1P78414 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IRX1P78414 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
IRX1P78414 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
IRX1P78414 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
IRX1P78414 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
IRX1P78414 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
IRX1P78414 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
IRX1P78414 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
IRX1P78414 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IRX1P78414 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IRX1P78414 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IRX1P78414 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IRX1P78414 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IRX1P78414 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IRX1P78414 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IRX1P78414 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
IRX1P78414 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IRX1P78414 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
IRX1P78414 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
IRX1P78414 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
IRX1P78414 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
IRX1P78414 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
IRX1P78414 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
IRX1P78414 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
IRX1P78414 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
IRX1P78414 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
IRX1P78414 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
IRX1P78414 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
IRX1P78414 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
IRX1P78414 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
IRX1P78414 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
IRX1P78414 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
IRX1P78414 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
IRX1P78414 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
IRX1P78414 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
IRX1P78414 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
IRX1P78414 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
IRX1P78414 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
IRX1P78414 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
IRX1P78414 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
IRX1P78414 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
IRX1P78414 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
IRX1P78414 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
IRX1P78414 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
IRX1P78414 TACR2-201ENST00000373306 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
IRX1P78414 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
IRX1P78414 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
IRX1P78414 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
IRX1P78414 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms