Protein–RNA interactions for Protein: P62316

SNRPD2, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPD2P62316 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNRPD2P62316 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNRPD2P62316 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNRPD2P62316 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNRPD2P62316 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNRPD2P62316 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNRPD2P62316 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNRPD2P62316 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNRPD2P62316 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNRPD2P62316 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNRPD2P62316 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNRPD2P62316 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNRPD2P62316 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNRPD2P62316 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNRPD2P62316 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNRPD2P62316 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNRPD2P62316 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNRPD2P62316 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNRPD2P62316 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SNRPD2P62316 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNRPD2P62316 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNRPD2P62316 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SNRPD2P62316 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SNRPD2P62316 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNRPD2P62316 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNRPD2P62316 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNRPD2P62316 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNRPD2P62316 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SNRPD2P62316 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNRPD2P62316 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNRPD2P62316 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNRPD2P62316 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNRPD2P62316 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNRPD2P62316 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNRPD2P62316 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNRPD2P62316 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNRPD2P62316 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNRPD2P62316 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNRPD2P62316 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNRPD2P62316 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNRPD2P62316 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNRPD2P62316 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNRPD2P62316 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNRPD2P62316 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNRPD2P62316 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNRPD2P62316 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNRPD2P62316 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNRPD2P62316 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNRPD2P62316 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNRPD2P62316 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNRPD2P62316 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNRPD2P62316 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNRPD2P62316 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNRPD2P62316 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNRPD2P62316 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNRPD2P62316 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNRPD2P62316 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SNRPD2P62316 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNRPD2P62316 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNRPD2P62316 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SNRPD2P62316 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNRPD2P62316 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SNRPD2P62316 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNRPD2P62316 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SNRPD2P62316 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNRPD2P62316 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNRPD2P62316 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNRPD2P62316 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNRPD2P62316 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SNRPD2P62316 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNRPD2P62316 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNRPD2P62316 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNRPD2P62316 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNRPD2P62316 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNRPD2P62316 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNRPD2P62316 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNRPD2P62316 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNRPD2P62316 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNRPD2P62316 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNRPD2P62316 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNRPD2P62316 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNRPD2P62316 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNRPD2P62316 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNRPD2P62316 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNRPD2P62316 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNRPD2P62316 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNRPD2P62316 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNRPD2P62316 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNRPD2P62316 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNRPD2P62316 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNRPD2P62316 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNRPD2P62316 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNRPD2P62316 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNRPD2P62316 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNRPD2P62316 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNRPD2P62316 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNRPD2P62316 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNRPD2P62316 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNRPD2P62316 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNRPD2P62316 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms