Protein–RNA interactions for Protein: P57773

GJA9, Gap junction alpha-9 protein, humanhuman

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA9P57773 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GJA9P57773 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GJA9P57773 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GJA9P57773 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GJA9P57773 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GJA9P57773 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GJA9P57773 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GJA9P57773 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GJA9P57773 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GJA9P57773 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GJA9P57773 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GJA9P57773 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GJA9P57773 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GJA9P57773 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GJA9P57773 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GJA9P57773 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GJA9P57773 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GJA9P57773 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GJA9P57773 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GJA9P57773 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GJA9P57773 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GJA9P57773 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GJA9P57773 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GJA9P57773 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GJA9P57773 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GJA9P57773 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GJA9P57773 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GJA9P57773 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GJA9P57773 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GJA9P57773 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GJA9P57773 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GJA9P57773 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GJA9P57773 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GJA9P57773 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GJA9P57773 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GJA9P57773 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GJA9P57773 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GJA9P57773 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GJA9P57773 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GJA9P57773 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GJA9P57773 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GJA9P57773 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GJA9P57773 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
GJA9P57773 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
GJA9P57773 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GJA9P57773 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GJA9P57773 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GJA9P57773 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GJA9P57773 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GJA9P57773 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
GJA9P57773 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GJA9P57773 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
GJA9P57773 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GJA9P57773 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GJA9P57773 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GJA9P57773 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GJA9P57773 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GJA9P57773 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GJA9P57773 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GJA9P57773 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GJA9P57773 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GJA9P57773 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GJA9P57773 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GJA9P57773 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GJA9P57773 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GJA9P57773 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GJA9P57773 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GJA9P57773 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GJA9P57773 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GJA9P57773 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GJA9P57773 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GJA9P57773 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GJA9P57773 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GJA9P57773 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GJA9P57773 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GJA9P57773 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GJA9P57773 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GJA9P57773 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GJA9P57773 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GJA9P57773 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GJA9P57773 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GJA9P57773 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GJA9P57773 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GJA9P57773 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GJA9P57773 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GJA9P57773 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
GJA9P57773 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GJA9P57773 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GJA9P57773 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GJA9P57773 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GJA9P57773 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GJA9P57773 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GJA9P57773 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GJA9P57773 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GJA9P57773 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GJA9P57773 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GJA9P57773 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GJA9P57773 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GJA9P57773 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GJA9P57773 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms