Protein–RNA interactions for Protein: P53621

COPA, Coatomer subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPAP53621 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
COPAP53621 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
COPAP53621 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
COPAP53621 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
COPAP53621 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
COPAP53621 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
COPAP53621 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
COPAP53621 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
COPAP53621 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
COPAP53621 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
COPAP53621 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
COPAP53621 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
COPAP53621 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
COPAP53621 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
COPAP53621 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
COPAP53621 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
COPAP53621 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
COPAP53621 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
COPAP53621 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
COPAP53621 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
COPAP53621 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
COPAP53621 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
COPAP53621 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
COPAP53621 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
COPAP53621 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
COPAP53621 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
COPAP53621 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
COPAP53621 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
COPAP53621 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
COPAP53621 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
COPAP53621 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
COPAP53621 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
COPAP53621 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
COPAP53621 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
COPAP53621 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
COPAP53621 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
COPAP53621 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
COPAP53621 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
COPAP53621 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
COPAP53621 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
COPAP53621 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
COPAP53621 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
COPAP53621 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
COPAP53621 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
COPAP53621 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
COPAP53621 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
COPAP53621 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
COPAP53621 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
COPAP53621 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
COPAP53621 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
COPAP53621 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
COPAP53621 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
COPAP53621 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
COPAP53621 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
COPAP53621 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
COPAP53621 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
COPAP53621 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
COPAP53621 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
COPAP53621 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
COPAP53621 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
COPAP53621 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
COPAP53621 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
COPAP53621 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
COPAP53621 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
COPAP53621 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
COPAP53621 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
COPAP53621 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
COPAP53621 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
COPAP53621 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
COPAP53621 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
COPAP53621 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
COPAP53621 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
COPAP53621 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
COPAP53621 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
COPAP53621 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
COPAP53621 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
COPAP53621 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
COPAP53621 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
COPAP53621 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
COPAP53621 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
COPAP53621 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
COPAP53621 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
COPAP53621 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
COPAP53621 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
COPAP53621 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
COPAP53621 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
COPAP53621 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
COPAP53621 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
COPAP53621 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
COPAP53621 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
COPAP53621 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
COPAP53621 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
COPAP53621 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
COPAP53621 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
COPAP53621 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
COPAP53621 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
COPAP53621 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
COPAP53621 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
COPAP53621 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
COPAP53621 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54 ms