Protein–RNA interactions for Protein: P52209

PGD, 6-phosphogluconate dehydrogenase, decarboxylating, humanhuman

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGDP52209 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PGDP52209 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PGDP52209 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PGDP52209 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PGDP52209 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PGDP52209 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PGDP52209 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PGDP52209 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PGDP52209 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PGDP52209 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PGDP52209 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PGDP52209 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PGDP52209 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PGDP52209 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PGDP52209 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PGDP52209 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PGDP52209 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.14
PGDP52209 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PGDP52209 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PGDP52209 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PGDP52209 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PGDP52209 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PGDP52209 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PGDP52209 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PGDP52209 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PGDP52209 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PGDP52209 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PGDP52209 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PGDP52209 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PGDP52209 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PGDP52209 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PGDP52209 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PGDP52209 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PGDP52209 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PGDP52209 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PGDP52209 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PGDP52209 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PGDP52209 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PGDP52209 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PGDP52209 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PGDP52209 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PGDP52209 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PGDP52209 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PGDP52209 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PGDP52209 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PGDP52209 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PGDP52209 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PGDP52209 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PGDP52209 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PGDP52209 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PGDP52209 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PGDP52209 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PGDP52209 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PGDP52209 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PGDP52209 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PGDP52209 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PGDP52209 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PGDP52209 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PGDP52209 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PGDP52209 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PGDP52209 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PGDP52209 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PGDP52209 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PGDP52209 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PGDP52209 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PGDP52209 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PGDP52209 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PGDP52209 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PGDP52209 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PGDP52209 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PGDP52209 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PGDP52209 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PGDP52209 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PGDP52209 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PGDP52209 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PGDP52209 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PGDP52209 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PGDP52209 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PGDP52209 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PGDP52209 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PGDP52209 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PGDP52209 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PGDP52209 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PGDP52209 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PGDP52209 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PGDP52209 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PGDP52209 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PGDP52209 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PGDP52209 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PGDP52209 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PGDP52209 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PGDP52209 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PGDP52209 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PGDP52209 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PGDP52209 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PGDP52209 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PGDP52209 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PGDP52209 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PGDP52209 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PGDP52209 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms