Protein–RNA interactions for Protein: P49841

GSK3B, Glycogen synthase kinase-3 beta, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSK3BP49841 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GSK3BP49841 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GSK3BP49841 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GSK3BP49841 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GSK3BP49841 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
GSK3BP49841 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GSK3BP49841 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GSK3BP49841 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GSK3BP49841 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GSK3BP49841 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GSK3BP49841 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
GSK3BP49841 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
GSK3BP49841 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GSK3BP49841 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GSK3BP49841 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GSK3BP49841 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GSK3BP49841 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GSK3BP49841 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GSK3BP49841 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GSK3BP49841 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GSK3BP49841 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GSK3BP49841 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GSK3BP49841 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GSK3BP49841 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GSK3BP49841 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GSK3BP49841 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
GSK3BP49841 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GSK3BP49841 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GSK3BP49841 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GSK3BP49841 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GSK3BP49841 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GSK3BP49841 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GSK3BP49841 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GSK3BP49841 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
GSK3BP49841 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GSK3BP49841 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GSK3BP49841 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GSK3BP49841 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GSK3BP49841 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GSK3BP49841 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GSK3BP49841 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GSK3BP49841 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GSK3BP49841 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GSK3BP49841 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GSK3BP49841 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GSK3BP49841 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GSK3BP49841 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GSK3BP49841 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GSK3BP49841 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GSK3BP49841 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
GSK3BP49841 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
GSK3BP49841 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GSK3BP49841 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GSK3BP49841 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GSK3BP49841 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GSK3BP49841 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
GSK3BP49841 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
GSK3BP49841 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GSK3BP49841 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GSK3BP49841 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GSK3BP49841 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GSK3BP49841 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GSK3BP49841 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GSK3BP49841 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GSK3BP49841 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GSK3BP49841 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
GSK3BP49841 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GSK3BP49841 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GSK3BP49841 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GSK3BP49841 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GSK3BP49841 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GSK3BP49841 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
GSK3BP49841 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GSK3BP49841 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GSK3BP49841 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GSK3BP49841 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GSK3BP49841 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GSK3BP49841 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GSK3BP49841 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GSK3BP49841 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GSK3BP49841 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GSK3BP49841 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GSK3BP49841 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GSK3BP49841 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GSK3BP49841 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GSK3BP49841 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GSK3BP49841 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GSK3BP49841 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GSK3BP49841 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GSK3BP49841 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GSK3BP49841 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GSK3BP49841 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GSK3BP49841 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GSK3BP49841 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GSK3BP49841 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
GSK3BP49841 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GSK3BP49841 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GSK3BP49841 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GSK3BP49841 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GSK3BP49841 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms