Protein–RNA interactions for Protein: P46736

BRCC3, Lys-63-specific deubiquitinase BRCC36, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRCC3P46736 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
BRCC3P46736 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
BRCC3P46736 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
BRCC3P46736 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
BRCC3P46736 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
BRCC3P46736 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
BRCC3P46736 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
BRCC3P46736 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
BRCC3P46736 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
BRCC3P46736 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.43
BRCC3P46736 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.43
BRCC3P46736 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
BRCC3P46736 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
BRCC3P46736 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
BRCC3P46736 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.43
BRCC3P46736 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
BRCC3P46736 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
BRCC3P46736 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
BRCC3P46736 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
BRCC3P46736 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
BRCC3P46736 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
BRCC3P46736 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
BRCC3P46736 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
BRCC3P46736 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
BRCC3P46736 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
BRCC3P46736 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
BRCC3P46736 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
BRCC3P46736 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
BRCC3P46736 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
BRCC3P46736 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
BRCC3P46736 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
BRCC3P46736 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
BRCC3P46736 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
BRCC3P46736 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
BRCC3P46736 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
BRCC3P46736 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
BRCC3P46736 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
BRCC3P46736 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
BRCC3P46736 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
BRCC3P46736 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
BRCC3P46736 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
BRCC3P46736 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
BRCC3P46736 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
BRCC3P46736 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
BRCC3P46736 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
BRCC3P46736 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
BRCC3P46736 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
BRCC3P46736 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
BRCC3P46736 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
BRCC3P46736 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
BRCC3P46736 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
BRCC3P46736 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
BRCC3P46736 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
BRCC3P46736 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
BRCC3P46736 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
BRCC3P46736 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
BRCC3P46736 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
BRCC3P46736 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
BRCC3P46736 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
BRCC3P46736 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
BRCC3P46736 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
BRCC3P46736 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
BRCC3P46736 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
BRCC3P46736 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
BRCC3P46736 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
BRCC3P46736 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
BRCC3P46736 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
BRCC3P46736 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
BRCC3P46736 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
BRCC3P46736 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
BRCC3P46736 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
BRCC3P46736 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
BRCC3P46736 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
BRCC3P46736 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
BRCC3P46736 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
BRCC3P46736 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
BRCC3P46736 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
BRCC3P46736 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
BRCC3P46736 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
BRCC3P46736 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
BRCC3P46736 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
BRCC3P46736 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BRCC3P46736 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BRCC3P46736 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BRCC3P46736 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
BRCC3P46736 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BRCC3P46736 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
BRCC3P46736 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
BRCC3P46736 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
BRCC3P46736 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
BRCC3P46736 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
BRCC3P46736 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
BRCC3P46736 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BRCC3P46736 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
BRCC3P46736 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BRCC3P46736 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BRCC3P46736 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BRCC3P46736 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BRCC3P46736 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BRCC3P46736 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms