Protein–RNA interactions for Protein: P41238

APOBEC1, C->U-editing enzyme APOBEC-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC1P41238 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
APOBEC1P41238 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
APOBEC1P41238 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
APOBEC1P41238 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
APOBEC1P41238 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
APOBEC1P41238 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
APOBEC1P41238 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
APOBEC1P41238 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
APOBEC1P41238 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
APOBEC1P41238 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
APOBEC1P41238 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
APOBEC1P41238 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
APOBEC1P41238 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
APOBEC1P41238 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
APOBEC1P41238 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
APOBEC1P41238 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
APOBEC1P41238 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
APOBEC1P41238 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
APOBEC1P41238 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
APOBEC1P41238 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
APOBEC1P41238 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
APOBEC1P41238 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
APOBEC1P41238 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
APOBEC1P41238 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
APOBEC1P41238 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
APOBEC1P41238 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
APOBEC1P41238 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
APOBEC1P41238 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
APOBEC1P41238 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
APOBEC1P41238 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
APOBEC1P41238 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
APOBEC1P41238 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
APOBEC1P41238 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
APOBEC1P41238 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
APOBEC1P41238 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
APOBEC1P41238 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
APOBEC1P41238 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
APOBEC1P41238 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
APOBEC1P41238 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
APOBEC1P41238 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
APOBEC1P41238 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
APOBEC1P41238 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
APOBEC1P41238 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
APOBEC1P41238 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
APOBEC1P41238 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
APOBEC1P41238 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
APOBEC1P41238 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
APOBEC1P41238 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
APOBEC1P41238 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
APOBEC1P41238 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
APOBEC1P41238 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
APOBEC1P41238 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
APOBEC1P41238 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
APOBEC1P41238 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
APOBEC1P41238 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
APOBEC1P41238 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
APOBEC1P41238 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
APOBEC1P41238 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
APOBEC1P41238 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
APOBEC1P41238 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
APOBEC1P41238 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
APOBEC1P41238 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
APOBEC1P41238 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
APOBEC1P41238 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
APOBEC1P41238 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
APOBEC1P41238 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
APOBEC1P41238 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
APOBEC1P41238 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
APOBEC1P41238 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
APOBEC1P41238 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
APOBEC1P41238 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
APOBEC1P41238 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
APOBEC1P41238 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
APOBEC1P41238 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
APOBEC1P41238 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
APOBEC1P41238 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
APOBEC1P41238 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
APOBEC1P41238 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
APOBEC1P41238 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
APOBEC1P41238 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
APOBEC1P41238 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
APOBEC1P41238 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
APOBEC1P41238 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
APOBEC1P41238 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
APOBEC1P41238 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
APOBEC1P41238 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
APOBEC1P41238 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
APOBEC1P41238 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
APOBEC1P41238 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
APOBEC1P41238 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
APOBEC1P41238 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
APOBEC1P41238 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
APOBEC1P41238 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
APOBEC1P41238 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
APOBEC1P41238 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
APOBEC1P41238 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
APOBEC1P41238 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
APOBEC1P41238 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
APOBEC1P41238 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
APOBEC1P41238 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms