Protein–RNA interactions for Protein: P35247

SFTPD, Pulmonary surfactant-associated protein D, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTPDP35247 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SFTPDP35247 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SFTPDP35247 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SFTPDP35247 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SFTPDP35247 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SFTPDP35247 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SFTPDP35247 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SFTPDP35247 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SFTPDP35247 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SFTPDP35247 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SFTPDP35247 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SFTPDP35247 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SFTPDP35247 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SFTPDP35247 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SFTPDP35247 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SFTPDP35247 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SFTPDP35247 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SFTPDP35247 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SFTPDP35247 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SFTPDP35247 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SFTPDP35247 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SFTPDP35247 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SFTPDP35247 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SFTPDP35247 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SFTPDP35247 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SFTPDP35247 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SFTPDP35247 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SFTPDP35247 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SFTPDP35247 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SFTPDP35247 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SFTPDP35247 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SFTPDP35247 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SFTPDP35247 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SFTPDP35247 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SFTPDP35247 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SFTPDP35247 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SFTPDP35247 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SFTPDP35247 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SFTPDP35247 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SFTPDP35247 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SFTPDP35247 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SFTPDP35247 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SFTPDP35247 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SFTPDP35247 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SFTPDP35247 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SFTPDP35247 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SFTPDP35247 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SFTPDP35247 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SFTPDP35247 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SFTPDP35247 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SFTPDP35247 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SFTPDP35247 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SFTPDP35247 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SFTPDP35247 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SFTPDP35247 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SFTPDP35247 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SFTPDP35247 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SFTPDP35247 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SFTPDP35247 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SFTPDP35247 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SFTPDP35247 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SFTPDP35247 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SFTPDP35247 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SFTPDP35247 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SFTPDP35247 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SFTPDP35247 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SFTPDP35247 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SFTPDP35247 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SFTPDP35247 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SFTPDP35247 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SFTPDP35247 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SFTPDP35247 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SFTPDP35247 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SFTPDP35247 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SFTPDP35247 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SFTPDP35247 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SFTPDP35247 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SFTPDP35247 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SFTPDP35247 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SFTPDP35247 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SFTPDP35247 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SFTPDP35247 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SFTPDP35247 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SFTPDP35247 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SFTPDP35247 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SFTPDP35247 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SFTPDP35247 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SFTPDP35247 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SFTPDP35247 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SFTPDP35247 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SFTPDP35247 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SFTPDP35247 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SFTPDP35247 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SFTPDP35247 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SFTPDP35247 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SFTPDP35247 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SFTPDP35247 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SFTPDP35247 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SFTPDP35247 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SFTPDP35247 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.3 ms