Protein–RNA interactions for Protein: P31271

HOXA13, Homeobox protein Hox-A13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA13P31271 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXA13P31271 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXA13P31271 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXA13P31271 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXA13P31271 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXA13P31271 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXA13P31271 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXA13P31271 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXA13P31271 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXA13P31271 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXA13P31271 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXA13P31271 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXA13P31271 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXA13P31271 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXA13P31271 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXA13P31271 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXA13P31271 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXA13P31271 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXA13P31271 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXA13P31271 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXA13P31271 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXA13P31271 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXA13P31271 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXA13P31271 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXA13P31271 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXA13P31271 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXA13P31271 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXA13P31271 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXA13P31271 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXA13P31271 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXA13P31271 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXA13P31271 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXA13P31271 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXA13P31271 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HOXA13P31271 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HOXA13P31271 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HOXA13P31271 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HOXA13P31271 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HOXA13P31271 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
HOXA13P31271 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HOXA13P31271 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
HOXA13P31271 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HOXA13P31271 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HOXA13P31271 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HOXA13P31271 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HOXA13P31271 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HOXA13P31271 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
HOXA13P31271 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HOXA13P31271 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HOXA13P31271 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HOXA13P31271 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HOXA13P31271 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
HOXA13P31271 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
HOXA13P31271 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
HOXA13P31271 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
HOXA13P31271 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
HOXA13P31271 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXA13P31271 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXA13P31271 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXA13P31271 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXA13P31271 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXA13P31271 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXA13P31271 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXA13P31271 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXA13P31271 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXA13P31271 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXA13P31271 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXA13P31271 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXA13P31271 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXA13P31271 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXA13P31271 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXA13P31271 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXA13P31271 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXA13P31271 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXA13P31271 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXA13P31271 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXA13P31271 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXA13P31271 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXA13P31271 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXA13P31271 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXA13P31271 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXA13P31271 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXA13P31271 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXA13P31271 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXA13P31271 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXA13P31271 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXA13P31271 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXA13P31271 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXA13P31271 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXA13P31271 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXA13P31271 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXA13P31271 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXA13P31271 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXA13P31271 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXA13P31271 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXA13P31271 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXA13P31271 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXA13P31271 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXA13P31271 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXA13P31271 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms