Protein–RNA interactions for Protein: P31270

HOXA11, Homeobox protein Hox-A11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA11P31270 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HOXA11P31270 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
HOXA11P31270 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HOXA11P31270 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HOXA11P31270 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HOXA11P31270 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HOXA11P31270 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
HOXA11P31270 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
HOXA11P31270 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HOXA11P31270 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
HOXA11P31270 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HOXA11P31270 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC18■□□□□ 0.47
HOXA11P31270 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HOXA11P31270 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXA11P31270 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXA11P31270 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXA11P31270 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXA11P31270 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXA11P31270 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXA11P31270 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXA11P31270 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXA11P31270 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXA11P31270 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXA11P31270 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXA11P31270 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXA11P31270 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXA11P31270 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXA11P31270 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXA11P31270 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXA11P31270 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXA11P31270 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXA11P31270 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXA11P31270 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXA11P31270 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXA11P31270 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXA11P31270 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXA11P31270 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXA11P31270 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXA11P31270 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXA11P31270 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXA11P31270 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXA11P31270 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXA11P31270 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXA11P31270 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXA11P31270 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXA11P31270 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXA11P31270 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXA11P31270 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXA11P31270 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXA11P31270 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXA11P31270 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXA11P31270 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXA11P31270 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXA11P31270 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXA11P31270 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXA11P31270 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXA11P31270 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXA11P31270 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXA11P31270 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXA11P31270 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXA11P31270 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXA11P31270 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXA11P31270 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXA11P31270 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXA11P31270 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXA11P31270 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXA11P31270 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXA11P31270 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXA11P31270 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXA11P31270 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXA11P31270 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXA11P31270 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXA11P31270 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXA11P31270 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXA11P31270 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXA11P31270 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXA11P31270 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXA11P31270 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXA11P31270 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXA11P31270 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXA11P31270 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXA11P31270 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXA11P31270 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXA11P31270 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXA11P31270 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXA11P31270 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXA11P31270 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXA11P31270 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXA11P31270 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXA11P31270 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXA11P31270 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXA11P31270 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXA11P31270 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXA11P31270 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXA11P31270 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXA11P31270 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXA11P31270 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXA11P31270 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXA11P31270 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXA11P31270 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms