Protein–RNA interactions for Protein: P30085

CMPK1, UMP-CMP kinase, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMPK1P30085 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CMPK1P30085 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CMPK1P30085 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CMPK1P30085 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CMPK1P30085 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CMPK1P30085 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CMPK1P30085 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CMPK1P30085 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CMPK1P30085 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CMPK1P30085 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CMPK1P30085 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CMPK1P30085 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CMPK1P30085 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CMPK1P30085 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CMPK1P30085 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CMPK1P30085 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CMPK1P30085 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CMPK1P30085 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CMPK1P30085 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CMPK1P30085 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CMPK1P30085 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CMPK1P30085 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CMPK1P30085 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CMPK1P30085 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CMPK1P30085 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CMPK1P30085 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CMPK1P30085 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CMPK1P30085 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CMPK1P30085 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CMPK1P30085 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CMPK1P30085 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CMPK1P30085 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CMPK1P30085 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CMPK1P30085 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CMPK1P30085 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CMPK1P30085 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CMPK1P30085 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CMPK1P30085 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CMPK1P30085 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CMPK1P30085 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CMPK1P30085 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CMPK1P30085 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CMPK1P30085 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CMPK1P30085 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CMPK1P30085 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CMPK1P30085 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CMPK1P30085 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CMPK1P30085 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CMPK1P30085 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CMPK1P30085 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CMPK1P30085 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CMPK1P30085 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CMPK1P30085 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CMPK1P30085 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CMPK1P30085 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CMPK1P30085 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CMPK1P30085 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CMPK1P30085 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CMPK1P30085 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CMPK1P30085 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CMPK1P30085 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CMPK1P30085 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CMPK1P30085 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CMPK1P30085 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CMPK1P30085 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CMPK1P30085 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CMPK1P30085 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CMPK1P30085 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CMPK1P30085 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CMPK1P30085 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CMPK1P30085 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CMPK1P30085 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CMPK1P30085 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CMPK1P30085 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CMPK1P30085 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CMPK1P30085 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CMPK1P30085 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CMPK1P30085 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CMPK1P30085 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CMPK1P30085 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CMPK1P30085 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CMPK1P30085 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CMPK1P30085 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CMPK1P30085 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CMPK1P30085 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CMPK1P30085 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CMPK1P30085 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CMPK1P30085 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CMPK1P30085 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CMPK1P30085 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CMPK1P30085 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CMPK1P30085 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CMPK1P30085 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CMPK1P30085 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CMPK1P30085 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CMPK1P30085 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CMPK1P30085 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CMPK1P30085 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CMPK1P30085 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CMPK1P30085 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.3 ms