Protein–RNA interactions for Protein: P29466

CASP1, Caspase-1, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP1P29466 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CASP1P29466 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CASP1P29466 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CASP1P29466 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CASP1P29466 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CASP1P29466 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CASP1P29466 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CASP1P29466 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CASP1P29466 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CASP1P29466 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
CASP1P29466 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CASP1P29466 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CASP1P29466 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CASP1P29466 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
CASP1P29466 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
CASP1P29466 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
CASP1P29466 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CASP1P29466 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CASP1P29466 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CASP1P29466 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
CASP1P29466 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CASP1P29466 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CASP1P29466 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CASP1P29466 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CASP1P29466 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CASP1P29466 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CASP1P29466 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CASP1P29466 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CASP1P29466 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CASP1P29466 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CASP1P29466 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CASP1P29466 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CASP1P29466 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CASP1P29466 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CASP1P29466 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CASP1P29466 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CASP1P29466 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CASP1P29466 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CASP1P29466 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CASP1P29466 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CASP1P29466 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CASP1P29466 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CASP1P29466 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CASP1P29466 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CASP1P29466 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CASP1P29466 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CASP1P29466 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CASP1P29466 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CASP1P29466 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CASP1P29466 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CASP1P29466 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CASP1P29466 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CASP1P29466 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CASP1P29466 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CASP1P29466 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CASP1P29466 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CASP1P29466 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CASP1P29466 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CASP1P29466 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CASP1P29466 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CASP1P29466 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CASP1P29466 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CASP1P29466 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CASP1P29466 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CASP1P29466 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CASP1P29466 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CASP1P29466 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CASP1P29466 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CASP1P29466 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CASP1P29466 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CASP1P29466 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CASP1P29466 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CASP1P29466 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CASP1P29466 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CASP1P29466 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CASP1P29466 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CASP1P29466 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CASP1P29466 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CASP1P29466 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CASP1P29466 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CASP1P29466 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CASP1P29466 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CASP1P29466 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CASP1P29466 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CASP1P29466 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CASP1P29466 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CASP1P29466 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CASP1P29466 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CASP1P29466 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CASP1P29466 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CASP1P29466 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CASP1P29466 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CASP1P29466 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CASP1P29466 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CASP1P29466 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CASP1P29466 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CASP1P29466 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CASP1P29466 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CASP1P29466 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CASP1P29466 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms