Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PTPRMP28827 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PTPRMP28827 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PTPRMP28827 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PTPRMP28827 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PTPRMP28827 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PTPRMP28827 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
PTPRMP28827 ARL16-201ENST00000397498 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PTPRMP28827 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PTPRMP28827 AL355334.1-201ENST00000417713 215 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
PTPRMP28827 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PTPRMP28827 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PTPRMP28827 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
PTPRMP28827 AC090386.1-202ENST00000586610 469 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PTPRMP28827 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PTPRMP28827 ARL16-214ENST00000621051 1181 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PTPRMP28827 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PTPRMP28827 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PTPRMP28827 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PTPRMP28827 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PTPRMP28827 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PTPRMP28827 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PTPRMP28827 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PTPRMP28827 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PTPRMP28827 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PTPRMP28827 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PTPRMP28827 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PTPRMP28827 BEX2-201ENST00000372674 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PTPRMP28827 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PTPRMP28827 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PTPRMP28827 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PTPRMP28827 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PTPRMP28827 HILPDA-202ENST00000435296 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PTPRMP28827 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
PTPRMP28827 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PTPRMP28827 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PTPRMP28827 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PTPRMP28827 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PTPRMP28827 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PTPRMP28827 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PTPRMP28827 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PTPRMP28827 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PTPRMP28827 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PTPRMP28827 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
PTPRMP28827 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PTPRMP28827 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PTPRMP28827 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PTPRMP28827 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PTPRMP28827 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
PTPRMP28827 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PTPRMP28827 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPRMP28827 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPRMP28827 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPRMP28827 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPRMP28827 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPRMP28827 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPRMP28827 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPRMP28827 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPRMP28827 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPRMP28827 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPRMP28827 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPRMP28827 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPRMP28827 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPRMP28827 PEA15-203ENST00000368077 1021 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPRMP28827 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPRMP28827 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPRMP28827 AC005077.2-201ENST00000449786 690 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPRMP28827 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPRMP28827 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPRMP28827 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPRMP28827 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPRMP28827 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPRMP28827 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPRMP28827 MIR7845-201ENST00000618396 99 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPRMP28827 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPRMP28827 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPRMP28827 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPRMP28827 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPRMP28827 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PTPRMP28827 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PTPRMP28827 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PTPRMP28827 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PTPRMP28827 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PTPRMP28827 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PTPRMP28827 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PTPRMP28827 AL358393.1-201ENST00000456771 532 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PTPRMP28827 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PTPRMP28827 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
PTPRMP28827 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PTPRMP28827 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PTPRMP28827 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PTPRMP28827 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PTPRMP28827 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PTPRMP28827 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PTPRMP28827 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PTPRMP28827 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PTPRMP28827 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PTPRMP28827 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PTPRMP28827 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PTPRMP28827 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
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