Protein–RNA interactions for Protein: P28074

PSMB5, Proteasome subunit beta type-5, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB5P28074 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PSMB5P28074 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PSMB5P28074 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PSMB5P28074 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PSMB5P28074 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PSMB5P28074 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PSMB5P28074 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PSMB5P28074 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PSMB5P28074 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PSMB5P28074 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PSMB5P28074 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PSMB5P28074 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PSMB5P28074 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PSMB5P28074 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PSMB5P28074 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PSMB5P28074 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PSMB5P28074 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PSMB5P28074 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PSMB5P28074 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PSMB5P28074 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PSMB5P28074 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PSMB5P28074 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PSMB5P28074 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PSMB5P28074 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PSMB5P28074 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PSMB5P28074 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PSMB5P28074 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PSMB5P28074 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PSMB5P28074 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PSMB5P28074 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PSMB5P28074 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PSMB5P28074 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PSMB5P28074 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PSMB5P28074 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PSMB5P28074 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PSMB5P28074 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PSMB5P28074 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PSMB5P28074 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PSMB5P28074 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PSMB5P28074 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PSMB5P28074 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PSMB5P28074 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PSMB5P28074 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PSMB5P28074 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PSMB5P28074 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PSMB5P28074 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PSMB5P28074 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PSMB5P28074 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PSMB5P28074 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PSMB5P28074 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PSMB5P28074 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PSMB5P28074 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PSMB5P28074 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PSMB5P28074 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PSMB5P28074 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PSMB5P28074 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PSMB5P28074 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PSMB5P28074 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PSMB5P28074 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PSMB5P28074 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PSMB5P28074 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PSMB5P28074 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PSMB5P28074 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PSMB5P28074 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PSMB5P28074 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PSMB5P28074 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PSMB5P28074 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PSMB5P28074 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PSMB5P28074 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PSMB5P28074 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PSMB5P28074 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSMB5P28074 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSMB5P28074 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSMB5P28074 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSMB5P28074 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSMB5P28074 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSMB5P28074 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSMB5P28074 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSMB5P28074 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSMB5P28074 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSMB5P28074 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSMB5P28074 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSMB5P28074 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSMB5P28074 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSMB5P28074 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSMB5P28074 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSMB5P28074 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSMB5P28074 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSMB5P28074 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSMB5P28074 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSMB5P28074 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSMB5P28074 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSMB5P28074 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSMB5P28074 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSMB5P28074 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSMB5P28074 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSMB5P28074 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSMB5P28074 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSMB5P28074 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSMB5P28074 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.6 ms