Protein–RNA interactions for Protein: P28070

PSMB4, Proteasome subunit beta type-4, humanhuman

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB4P28070 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PSMB4P28070 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PSMB4P28070 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PSMB4P28070 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PSMB4P28070 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PSMB4P28070 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PSMB4P28070 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PSMB4P28070 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PSMB4P28070 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
PSMB4P28070 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PSMB4P28070 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PSMB4P28070 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
PSMB4P28070 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PSMB4P28070 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PSMB4P28070 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PSMB4P28070 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PSMB4P28070 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PSMB4P28070 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PSMB4P28070 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PSMB4P28070 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PSMB4P28070 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
PSMB4P28070 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PSMB4P28070 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
PSMB4P28070 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
PSMB4P28070 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
PSMB4P28070 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PSMB4P28070 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PSMB4P28070 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PSMB4P28070 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PSMB4P28070 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PSMB4P28070 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PSMB4P28070 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PSMB4P28070 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PSMB4P28070 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PSMB4P28070 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PSMB4P28070 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PSMB4P28070 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PSMB4P28070 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PSMB4P28070 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PSMB4P28070 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PSMB4P28070 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PSMB4P28070 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PSMB4P28070 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PSMB4P28070 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PSMB4P28070 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PSMB4P28070 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PSMB4P28070 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PSMB4P28070 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PSMB4P28070 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PSMB4P28070 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
PSMB4P28070 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
PSMB4P28070 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PSMB4P28070 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
PSMB4P28070 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PSMB4P28070 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PSMB4P28070 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PSMB4P28070 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PSMB4P28070 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PSMB4P28070 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
PSMB4P28070 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PSMB4P28070 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
PSMB4P28070 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PSMB4P28070 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PSMB4P28070 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PSMB4P28070 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PSMB4P28070 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PSMB4P28070 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PSMB4P28070 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PSMB4P28070 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PSMB4P28070 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PSMB4P28070 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PSMB4P28070 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PSMB4P28070 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PSMB4P28070 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PSMB4P28070 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
PSMB4P28070 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PSMB4P28070 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PSMB4P28070 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PSMB4P28070 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PSMB4P28070 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PSMB4P28070 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PSMB4P28070 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PSMB4P28070 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PSMB4P28070 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PSMB4P28070 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PSMB4P28070 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PSMB4P28070 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PSMB4P28070 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PSMB4P28070 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PSMB4P28070 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PSMB4P28070 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PSMB4P28070 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PSMB4P28070 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PSMB4P28070 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PSMB4P28070 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
PSMB4P28070 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PSMB4P28070 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PSMB4P28070 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PSMB4P28070 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PSMB4P28070 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.5 ms